Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  310  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Number
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Score
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Period
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Copy
Number
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Score
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19
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1.41
Indices
Period
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Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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17
3.2
15
80
17
52
41
1
1
54
1.22
98318827--98318866
14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
98321687--98321737
18
2.8
18
75
0
66
39
3
43
13
1.63
98330206--98330431
48
4.7
47
81
3
263
19
17
26
36
1.94
98330203--98330441
96
2.5
97
86
4
324
19
17
27
35
1.94
98333369--98333397
13
2.2
13
100
0
58
24
24
13
37
1.91
98334542--98334717
48
3.7
48
83
3
237
18
17
28
36
1.93
98334535--98334717
96
1.9
96
91
0
303
18
16
28
36
1.93
98337167--98337203
19
1.9
19
100
0
74
21
27
27
24
1.99
98339664--98339688
13
1.9
13
100
0
50
36
0
8
56
1.29
98340218--98340259
21
2.0
22
85
4
59
38
19
19
23
1.93
98351115--98351166
26
2.0
27
84
3
70
40
3
15
40
1.65
98351721--98351753
11
2.8
12
90
9
50
21
3
6
69
1.24
98351827--98351878
21
2.4
22
90
3
79
32
1
7
57
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98352164--98352197
8
4.0
8
85
14
50
23
0
0
76
0.79
98358709--98358760
20
2.5
20
82
14
70
28
15
7
48
1.73
98365626--98365661
18
1.9
18
88
5
54
47
5
25
22
1.73
98368352--98368394
21
2.0
21
100
0
86
41
9
13
34
1.77
98368843--98368903
28
2.1
29
81
3
70
31
6
1
60
1.32
98369166--98369200
18
2.0
18
88
5
54
62
2
8
25
1.38
98373251--98373291
15
2.7
15
88
0
55
63
7
2
26
1.33
98373286--98373340
27
2.0
28
92
3
94
49
7
10
32
1.65
98380183--98380232
17
3.0
16
80
8
55
70
6
8
16
1.32
98380592--98380675
35
2.4
35
75
18
95
40
1
2
55
1.20
98381757--98381864
45
2.5
46
82
7
127
22
25
16
36
1.94
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3.8
43
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1
202
29
24
20
26
1.99
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16
2.8
16
80
16
56
25
0
2
72
0.96
98396026--98396064
19
2.1
19
100
0
78
41
5
10
43
1.61
98396499--98396541
15
2.9
15
82
3
61
44
30
0
25
1.55
98396502--98396550
15
3.4
14
83
8
55
46
30
0
22
1.52
98396556--98396618
14
4.4
14
78
7
65
31
47
1
19
1.59
98396627--98396661
15
2.4
14
86
9
52
45
31
0
22
1.53
98396699--98396876
41
4.4
41
89
2
252
20
24
22
32
1.98
98397293--98397381
23
3.6
24
72
20
85
37
4
5
52
1.45
98397293--98397393
26
4.0
24
71
20
82
36
4
5
52
1.48
98400261--98400435
46
3.8
45
76
10
165
29
27
20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98400269--98400439
93
1.8
93
88
0
261
28
27
21
22
1.99
98403830--98404083
46
5.6
46
85
4
320
22
29
21
26
1.99
98403830--98404083
138
1.9
136
86
5
368
22
29
21
26
1.99
98403830--98404083
92
2.8
92
92
2
415
22
29
21
26
1.99
98406878--98407047
46
3.7
46
74
16
170
29
28
20
21
1.98
98406886--98407056
93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
22
1.99
98406979--98407064
46
1.9
45
83
4
111
32
27
17
22
1.96
98416462--98416530
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2.3
31
85
7
88
44
23
8
23
1.80
98420513--98420572
30
2.0
30
93
0
102
46
16
16
20
1.84
98423334--98423373
21
1.9
21
84
0
53
40
22
20
17
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325