Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  275  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88330543--88330580
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2.2
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0
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2.4
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18
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11
38
1.80
88337071--88337249
70
2.5
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290
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1.80
88337071--88337249
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166
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207
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0
6
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25
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0
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74
0
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0
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3.2
26
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11
89
47
10
4
36
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
1
20
0.84
88369396--88369456
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3.5
17
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2
95
78
0
1
19
0.83
88369397--88369456
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5.3
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20
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0
23
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405
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2.1
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19
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3.1
19
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2.0
20
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56
5
0
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5
0
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7
2
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1.34
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19
2.9
18
83
10
63
24
3
0
71
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.43
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24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
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9
4.2
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53
0
0
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1.00
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2.0
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1.65
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2.2
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1
7
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2.6
22
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19
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1.98
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19.7
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1.9
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0
108
37
22
22
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88467303--88467341
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3.2
12
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0
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56
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20
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1.34
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2
17
35
1.62
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2.2
21
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4
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32
1.68
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19
2.0
19
100
0
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5
21
1.66
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14
2.2
14
100
0
62
19
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19
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1.86
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14
2.1
16
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50
50
18
0
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1.48
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1.85
88528439--88528465
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100
0
54
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18
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48
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2.0
40
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20
2.0
20
100
0
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60
0
9
29
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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18
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33
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1.83
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2.3
21
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16
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0
0
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0
0
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0
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17
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5
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10
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2.7
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28
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22
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0
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1.34
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1.26
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10
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1.20
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22
2.1
22
88
8
67
60
4
2
32
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88608863--88608922
23
2.6
22
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0
0
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18
2.1
19
95
5
69
65
5
0
28
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325