Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  16  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6300720--6300767
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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20
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2.2
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3
1
61
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.4
22
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0
106
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15
32
15
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6531297--6531434
25
5.5
25
91
0
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33
18
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1.97
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1.28
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28
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10
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55
53
15
31
0
1.43
6548115--6548144
6
5.0
6
91
0
51
30
16
0
53
1.44
6548874--6548925
21
2.5
21
87
0
68
17
1
32
48
1.58
6549183--6549554
126
3.0
126
96
0
681
35
19
20
24
1.96
6551941--6551976
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
6551928--6551968
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
6552603--6552655
15
3.5
15
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0
70
49
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1
37
1.50
6553503--6553541
19
2.1
19
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33
5
10
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1.58
6553506--6553549
19
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19
78
17
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34
6
9
50
1.61
6554372--6555403
512
2.0
513
99
0
2021
30
18
21
29
1.97
6557334--6557376
18
2.4
18
88
0
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6
27
18
1.75
6557442--6557531
30
3.0
29
82
9
110
10
16
40
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6557470--6557518
15
3.3
15
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21
57
8
16
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32
1.77
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103
2.6
104
90
3
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19
20
29
29
1.97
6567062--6567327
103
2.6
104
90
3
419
19
20
29
29
1.97
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13
2.0
13
100
0
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0
23
0
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21
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1.49
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1.9
30
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36
1
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1.42
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12
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0
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0
50
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1.00
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15
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0
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0
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27
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2.0
54
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1.44
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2.8
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0
0
53
1.00
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2.0
25
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0
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1.77
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17
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20
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10
0
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1.37
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17
2.7
20
78
18
70
10
0
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46
1.37
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21
4.4
21
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20
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31
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5
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2.0
63
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0
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7
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2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6656880--6656969
33
2.5
38
74
20
93
53
3
1
42
1.24
6656906--6656957
18
3.1
18
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10
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55
1
0
42
1.10
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33
2.0
33
100
0
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25
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24
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0
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0
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50
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11
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3
59
42
1
0
55
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325