Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  251  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79682775--79682853
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79685474--79685827
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93
0
301
27
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4
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
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38
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21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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22
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16
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1.80
79861901--79861991
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2.3
40
90
3
139
26
29
19
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79861901--79862046
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21
9
28
1.84
79872791--79872973
27
6.8
27
76
3
113
39
22
9
28
1.85
79872955--79873546
27
22.3
27
87
3
781
33
20
20
25
1.97
79873182--79873221
19
2.1
19
100
0
80
27
20
25
27
1.99
79873975--79874036
22
2.8
23
80
7
65
24
19
20
35
1.96
79874194--79874295
27
3.8
26
80
5
96
21
22
18
37
1.94
79874452--79874607
6
25.8
6
73
15
126
19
15
14
50
1.78
79874427--79874584
31
5.4
30
80
11
175
19
15
15
49
1.80
79874427--79874607
85
2.1
84
89
4
274
18
16
15
49
1.79
79876868--79876899
15
2.0
17
88
11
50
25
0
31
43
1.55
79883625--79883681
5
10.6
5
77
19
53
15
5
1
77
1.03
79883620--79883657
14
2.7
14
92
8
60
18
2
0
78
0.86
79886529--79886561
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
79904610--79904648
20
2.0
20
85
5
53
53
20
2
23
1.57
79922315--79922486
47
3.6
47
76
10
141
26
18
29
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79922219--79922486
46
5.7
47
74
11
178
26
18
29
25
1.98
79926968--79927011
18
2.5
18
81
3
54
18
38
22
20
1.93
79927515--79927562
20
2.3
20
85
7
60
54
8
25
12
1.65
79932886--79932929
18
2.5
18
85
10
56
38
4
6
50
1.50
79937247--79937323
35
2.2
35
95
0
136
38
27
6
27
1.81
79938998--79939036
17
2.3
17
100
0
78
69
5
5
20
1.28
79939970--79940039
34
2.1
33
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2
113
50
14
12
22
1.77
79940352--79940396
22
2.1
22
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51
31
0
17
1.46
79941099--79941134
18
2.0
18
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0
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22
0
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1.54
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2.0
21
100
0
82
34
0
9
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1.32
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120
2.6
117
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3
548
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1
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51
1.30
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2.2
102
95
0
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1
3
51
1.28
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14
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15
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14
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47
0
0
52
1.00
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2.2
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135
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16
4.1
16
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0
112
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1.74
79951974--79952012
20
2.0
20
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48
0
0
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1.00
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2.1
37
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0
122
25
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24
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47
10.1
47
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2
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28
29
9
32
1.88
79961617--79962015
190
2.1
190
81
2
462
32
19
22
25
1.97
79968414--79968438
13
1.9
13
100
0
50
24
8
24
44
1.80
79968309--79968555
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2.4
101
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25
31
1.95
79968457--79968604
56
2.6
56
92
0
233
27
13
23
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79968523--79968630
56
1.9
56
81
3
128
27
14
25
32
1.95
79971020--79971149
48
2.6
50
82
2
156
26
32
15
26
1.95
79973172--79973201
5
5.8
5
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51
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0
0
56
0.99
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1.8
92
96
0
313
28
28
21
21
1.99
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3.7
46
80
11
217
29
27
21
21
1.99
79979691--79979879
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4.1
46
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17
151
28
28
21
21
1.99
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2.0
30
90
0
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30
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1.85
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96
0
315
28
29
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21
1.98
79987165--79987337
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
79987761--79987820
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325