Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  52  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18786439--18786477
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20
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29
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21
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28
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20
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29
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62
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140
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4
58
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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17
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0
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53
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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28
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30
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1.91
18961623--18961724
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2.7
39
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10
113
27
28
21
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18977086--18977150
30
2.1
29
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43
0
1
55
1.09
18977098--18977168
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18
15
1.58
19000537--19000581
22
2.0
23
95
4
83
42
22
17
17
1.89
19000772--19000865
27
3.6
24
81
15
93
46
32
4
15
1.66
19000786--19000868
27
3.0
28
91
5
132
46
30
3
19
1.66
19006643--19006692
26
1.9
26
95
0
91
30
32
24
14
1.94
19006610--19006873
104
2.6
102
90
3
404
29
29
20
19
1.97
19007200--19007264
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
19007207--19007264
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
19010857--19010939
31
2.7
30
74
7
76
57
13
6
22
1.57
19011918--19011966
21
2.3
21
86
6
64
61
4
0
34
1.15
19012310--19012375
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19
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27
3
13
56
1.52
19020548--19020598
22
2.2
23
86
10
68
50
0
1
47
1.12
19026113--19026185
28
2.9
24
77
15
92
12
24
4
58
1.51
19031671--19031701
6
5.2
6
96
0
53
29
38
0
32
1.57
19032106--19032132
12
2.2
12
100
0
54
11
29
0
59
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19036011--19036051
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
19045687--19045714
2
14.0
2
100
0
56
0
50
0
50
1.00
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10
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10
73
17
58
40
0
1
58
1.08
19047095--19047156
19
3.1
21
80
15
60
41
0
1
56
1.09
19047098--19047194
28
3.4
27
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12
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40
0
2
57
1.10
19047125--19047210
38
2.2
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8
113
43
0
2
54
1.13
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2.9
19
80
14
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65
0
1
32
1.03
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14
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0
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1.09
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7
0
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23
6
2
67
1.25
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25
5.5
25
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2
206
22
26
18
33
1.96
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22
3.1
21
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14
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14
25
20
38
1.91
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51
4.4
50
88
1
338
33
14
22
30
1.93
19064760--19064982
101
2.2
101
95
0
401
33
14
22
30
1.93
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4.5
50
88
1
346
32
14
23
29
1.94
19071519--19071745
101
2.2
101
96
0
409
32
14
23
29
1.94
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10
4.1
10
84
3
57
21
4
2
71
1.16
19078632--19078671
20
2.0
20
95
0
71
20
5
2
72
1.15
19084674--19084781
28
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29
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3
141
22
3
30
43
1.70
19084985--19085050
23
3.0
22
76
14
82
15
21
24
39
1.91
19089447--19089491
19
2.4
19
96
0
81
24
31
17
26
1.97
19091364--19091396
16
2.1
16
100
0
66
51
0
30
18
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19095976--19096032
27
2.1
27
100
0
114
57
3
3
35
1.33
19096661--19096721
23
2.7
23
86
0
77
59
6
1
32
1.33
19099374--19099413
2
20.0
2
100
0
80
0
50
0
50
1.00
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237
4.0
233
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11
820
36
9
8
45
1.66
19108934--19108967
16
2.1
17
88
5
52
47
0
8
44
1.34
19108496--19109701
490
2.5
478
78
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1268
37
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7
46
1.64
19110942--19111073
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2.0
66
96
0
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2
18
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1.45
19119486--19119550
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2.2
30
78
8
71
29
13
9
47
1.74
19121520--19121558
20
2.0
20
89
0
60
12
10
17
58
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325