Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  65  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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Score
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0
46
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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73
30
0
6
64
1.18
23572075--23572127
21
2.6
21
88
5
65
49
18
18
13
1.80
23572084--23572127
21
2.1
21
95
0
79
50
18
18
13
1.79
23575227--23575334
10
11.1
10
70
11
55
30
5
1
62
1.29
23575288--23575330
19
2.3
19
87
0
59
23
2
2
72
1.08
23575312--23575370
27
2.1
28
81
12
77
38
3
0
57
1.15
23575318--23575372
27
2.0
27
89
6
85
40
3
0
56
1.17
23577011--23577043
17
1.9
17
93
0
57
33
21
12
33
1.90
23580009--23580047
6
6.5
6
100
0
78
0
15
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1.45
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13
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60
0
6
33
1.23
23587267--23587339
37
2.0
37
94
0
128
19
20
6
53
1.67
23587640--23587686
7
6.4
7
80
9
58
70
2
0
27
0.99
23587640--23587686
15
3.2
14
82
8
58
70
2
0
27
0.99
23587646--23587702
22
2.6
20
79
17
60
64
1
1
31
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23587810--23587926
59
1.9
61
86
5
166
32
4
1
61
1.25
23588706--23588730
12
2.1
12
100
0
50
32
0
0
68
0.90
23593090--23593140
6
8.5
6
88
0
75
19
1
11
66
1.33
23593089--23593150
18
3.4
18
81
0
70
24
3
11
61
1.44
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15
3.1
15
87
0
74
23
6
30
39
1.80
23595453--23595595
40
3.5
40
94
0
232
20
9
22
47
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2.0
20
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0
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12
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20
1.89
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38
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10
23
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5.0
41
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20
1.96
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2.2
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35
22
22
20
1.96
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0
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21
3.7
21
73
19
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28
2
27
42
1.68
23601058--23601154
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2.0
46
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29
3
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3.6
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0
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0
0
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15
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0
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14
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7
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0
0
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4.2
19
69
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26
3
2
67
1.21
23608821--23608941
43
2.8
43
92
0
197
23
16
35
24
1.95
23608821--23608958
43
3.2
42
86
6
161
22
17
34
26
1.96
23612919--23612999
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2.5
31
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6
81
44
4
6
44
1.50
23615177--23615209
4
8.2
4
100
0
66
24
0
27
48
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23617974--23618509
132
4.1
131
84
4
596
35
19
19
26
1.95
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2
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2
100
0
62
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0
0
48
1.00
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30
1.9
30
100
0
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2
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2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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2.0
20
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0
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5
2
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1.38
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41
0
0
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0
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55
0
0
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11
6.6
10
74
19
59
50
1
1
46
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325