Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  89  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29846778--29847554
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8.8
88
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1.04
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463
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2.0
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0
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28
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2.0
20
100
0
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17
34
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2
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27
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25
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1.98
29897656--29897879
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2.0
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72
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76
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2
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5.6
29
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23
69
34
1
1
62
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
1
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1.11
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18
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1
1
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1.11
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2.4
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2
1
65
1.13
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4.4
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35
1
1
60
1.17
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1.8
90
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212
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1
1
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1.16
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0
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2.6
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18
0
39
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29953685--29953790
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0
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36
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0
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42
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0
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23
2.1
24
92
3
84
46
2
32
20
1.62
29962462--29962522
25
2.4
25
81
5
79
19
19
32
27
1.96
29962738--29962933
62
3.2
60
76
16
190
42
3
3
50
1.35
29967143--29967402
114
2.3
113
91
4
407
31
13
19
35
1.91
29967366--29967402
18
2.1
18
89
0
56
24
16
27
32
1.96
29969168--29969371
95
2.1
95
88
0
291
38
20
18
23
1.93
29970820--29970900
36
2.3
36
95
2
146
46
3
29
19
1.67
29971248--29971282
17
2.1
17
88
0
52
71
0
2
25
1.00
29971241--29971312
27
2.7
27
81
12
69
65
0
4
30
1.12
29977382--29977452
35
2.0
35
100
0
142
30
5
35
28
1.80
29980228--29980269
6
7.0
6
97
0
66
38
45
0
16
1.48
29982397--29982430
17
2.0
17
88
11
52
52
17
17
11
1.73
29983653--29983715
31
2.0
31
90
0
99
41
3
0
55
1.16
29983653--29983739
31
2.8
31
81
8
90
41
2
1
55
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29994682--29995094
41
10.1
41
85
5
453
34
22
22
20
1.97
29994753--29995094
122
2.8
123
86
1
508
33
23
22
21
1.97
29994753--29995094
82
4.2
82
88
1
508
33
23
22
21
1.97
29995252--29995358
14
7.4
14
68
8
70
28
0
26
44
1.60
29995265--29995344
21
3.6
21
69
12
70
28
1
26
43
1.62
29995447--29995488
21
2.0
21
90
0
66
19
0
40
40
1.51
30000025--30000065
19
2.2
19
86
4
57
21
2
4
70
1.18
30000316--30000417
43
2.4
43
86
1
134
21
21
30
26
1.98
30000576--30000622
22
2.1
22
100
0
94
38
21
4
36
1.73
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3.0
17
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13
56
57
9
0
33
1.31
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3
22.0
3
100
0
132
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0
0
33
0.92
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1.8
87
83
2
214
33
19
18
28
1.96
30005337--30005782
75
6.0
74
84
5
487
32
19
17
30
1.95
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149
3.8
145
79
9
510
31
20
17
30
1.96
30005665--30005921
132
1.9
132
84
6
345
29
21
17
31
1.96
30018068--30018102
17
2.1
17
89
10
54
62
11
0
25
1.28
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28
2.4
30
78
9
79
57
2
7
31
1.40
30018939--30018998
3
20.3
3
96
3
113
66
0
0
33
0.92
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10
2.5
10
100
0
50
32
0
16
52
1.44
30021252--30021346
47
2.0
47
97
0
181
14
10
11
63
1.53
30027026--30027112
26
3.1
26
72
23
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39
10
5
44
1.62
30029792--30029962
85
2.0
86
94
1
299
33
16
19
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30031049--30031199
30
5.1
30
91
4
245
26
23
6
43
1.78
30031049--30031199
59
2.5
60
92
4
245
26
23
6
43
1.78
30035757--30035880
30
4.1
30
93
1
203
25
24
6
43
1.78
30035767--30035874
15
7.2
15
67
12
78
25
22
7
44
1.79
30041390--30041545
27
5.8
27
81
10
176
33
21
25
19
1.96
30041405--30041548
54
2.7
54
92
2
236
34
22
25
17
1.96
30043161--30043268
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
30048517--30048670
27
5.7
27
80
11
156
34
20
25
19
1.96
30048532--30048670
54
2.6
54
89
3
210
35
22
24
17
1.96
30050256--30050363
26
4.2
26
92
0
180
36
23
7
33
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325