Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  75  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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25
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1.95
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2.0
24
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2.0
22
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1.18
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1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
26450285--26450354
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1.78
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11
2.8
12
86
13
50
46
0
0
53
1.00
26476537--26476574
17
2.2
18
85
4
51
21
7
18
52
1.70
26478818--26478847
11
2.7
11
100
0
60
60
6
6
26
1.47
26483698--26483738
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
26488493--26488538
16
2.7
18
73
13
51
60
0
0
39
0.97
26491824--26491864
21
1.9
22
90
5
66
43
9
17
29
1.80
26515471--26515645
46
3.8
46
77
13
196
29
29
20
21
1.98
26515479--26515649
93
1.8
93
92
0
288
28
29
21
21
1.98
26518076--26518163
43
2.0
43
93
0
149
27
34
29
9
1.87
26519994--26520036
16
2.8
15
80
13
52
16
4
2
76
1.05
26520005--26520078
6
13.2
6
76
11
59
20
4
0
75
0.96
26520009--26520078
5
12.8
5
77
16
68
20
4
0
75
0.96
26520005--26520078
11
6.6
11
73
14
71
20
4
0
75
0.96
26520005--26520078
17
4.4
16
81
8
94
20
4
0
75
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26525892--26526008
3
40.0
3
73
8
80
58
2
6
31
1.37
26525895--26526056
23
7.0
23
70
17
102
56
2
8
32
1.43
26525892--26525953
26
2.3
27
80
5
72
61
1
6
30
1.31
26525892--26526008
43
2.7
43
78
6
119
58
2
6
31
1.37
26526726--26526777
25
2.1
25
89
7
79
82
0
11
5
0.82
26526725--26526773
20
2.5
19
83
6
71
81
0
14
4
0.83
26527430--26527925
182
2.7
182
90
0
742
27
19
18
34
1.95
26527718--26527827
43
2.5
45
80
2
116
27
22
21
28
1.99
26527910--26528045
44
3.1
44
65
19
111
24
21
22
32
1.98
26527910--26528709
88
9.1
88
84
1
1014
21
23
21
33
1.97
26528077--26528483
44
9.3
43
65
11
218
20
23
21
34
1.97
26527945--26528797
44
19.5
44
62
11
192
21
23
21
33
1.97
26534528--26534565
20
1.9
20
88
0
58
60
13
15
10
1.59
26535690--26535732
15
2.9
15
82
0
50
48
0
13
37
1.43
26535852--26535990
3
47.3
3
74
7
97
58
2
7
31
1.40
26535857--26535978
23
5.4
23
76
11
126
59
3
6
31
1.39
26535862--26535987
44
2.8
44
81
2
144
57
3
7
30
1.43
26536758--26536795
20
1.9
20
94
0
67
81
0
13
5
0.85
26541282--26541336
26
2.2
24
90
6
83
25
18
20
36
1.94
26541317--26541386
23
2.9
24
85
6
97
30
21
14
34
1.93
26541931--26541967
18
2.1
18
100
0
74
21
5
24
48
1.71
26545622--26545709
41
2.1
41
91
0
140
35
19
25
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26546325--26546373
24
2.0
24
92
0
80
53
2
2
42
1.24
26546654--26546806
7
21.6
7
73
7
67
20
0
34
44
1.56
26546705--26546785
21
3.8
21
77
11
85
18
0
40
40
1.51
26546928--26546994
14
4.7
14
85
3
89
40
4
16
38
1.69
26547547--26547604
22
2.7
21
82
15
73
65
1
1
31
1.13
26547602--26547728
40
3.2
39
81
14
161
44
17
21
16
1.86
26547615--26547723
38
2.8
40
92
5
195
40
20
22
16
1.91
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2.4
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32
35
4
27
1.78
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9
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9
86
0
82
45
23
1
28
1.63
26550731--26550789
27
2.2
27
90
0
100
45
23
1
28
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325