Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  297  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.97
Indices
Period
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Score
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20
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23
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Period
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5
49
1.39
94790331--94790365
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
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144
1.9
147
93
3
478
47
2
3
47
1.32
94790475--94790509
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
94790671--94790765
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
94790746--94790797
16
3.2
16
94
0
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34
36
0
28
1.58
94791895--94792123
126
1.8
125
90
2
370
27
14
16
40
1.88
94803320--94803581
44
6.0
44
70
14
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38
20
17
23
1.93
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22
1.98
94807487--94807719
54
4.1
54
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7
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1.41
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2
9
43
1.48
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15
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15
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12
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0
1
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1.11
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120
1.8
120
100
0
432
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1
6
49
1.38
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15
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14
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45
0
2
52
1.13
94807709--94807750
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
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28
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1.80
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16
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0
95
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36
0
26
1.57
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188
1.8
186
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2
611
26
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6
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1.47
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23
2.9
23
77
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41
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17
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0
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1.87
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39
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0
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25
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30
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0
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1.00
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24
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0
0
50
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0
0
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42
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18
1.89
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17
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6.5
40
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229
27
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14
3.9
14
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25
1
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1.61
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2.3
18
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0
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48
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6.0
6
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0
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16
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17
2.4
17
95
4
73
22
25
15
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94858344--94858743
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2.1
192
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2.3
19
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4
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38
0
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1.44
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35
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2.2
105
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0
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35
80
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278
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14
20
32
1.93
94888354--94888632
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2.7
105
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0
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22
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2
100
0
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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