Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  108  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
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10
16
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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20
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34610269--34610380
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119
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0
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19
15
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
5
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1.28
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2.2
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2
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1.21
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2.0
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61
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34696471--34696578
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25
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21
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2.5
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0
106
28
26
17
26
1.98
34723889--34723969
19
4.2
19
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3
126
38
8
18
34
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34724475--34724523
26
2.0
25
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8
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20
6
8
65
1.41
34729542--34729610
16
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15
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0
14
2
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21
3.3
19
79
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0
13
3
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34729539--34729604
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0
13
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34729542--34729610
14
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0
14
2
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34729550--34729610
23
2.6
23
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0
13
3
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34729541--34729610
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0
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44
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132
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26
1.97
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500
31
18
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26
1.97
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175
2.0
176
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1
570
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18
23
26
1.97
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206
4.6
206
93
0
1540
30
18
21
28
1.97
34731994--34732027
15
2.3
15
89
0
50
23
17
20
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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11
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35
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36
2.0
36
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0
126
38
11
15
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1.83
34732381--34732480
19
5.3
19
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7
105
38
10
17
35
1.83
34732984--34733032
26
2.0
25
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20
6
8
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40
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1.99
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21
24
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26
1.99
34747419--34747647
39
5.8
39
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264
21
24
27
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1.99
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19
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19
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35
2
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1.56
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2.2
43
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17
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73
1
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0
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1
31
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1.01
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2.4
37
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64
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34784669--34784736
28
2.4
28
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2
29
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2.3
59
80
8
147
25
26
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34792583--34792632
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25
10
0
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5
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34793184--34793230
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2.9
16
84
9
51
27
10
2
59
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325