Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  287  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91971529--91972380
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425
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30
20
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10
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80
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1
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15
1
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2.2
32
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10
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2.7
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27
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3.0
41
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5
128
33
18
23
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
17
28
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92026539--92026578
14
2.9
14
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1.50
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1.9
17
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1
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1.00
92038271--92038318
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2.2
22
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6
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92038279--92038319
22
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92038346--92038396
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0
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11.3
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0
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2.8
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16
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0
0
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2.0
30
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26
34
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1.93
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20
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53
30
0
0
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0.89
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2.0
29
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10
5
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1.61
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27
2.1
26
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1
28
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1.10
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2.1
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3
67
1
26
1
69
1.08
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3.1
138
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1
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23
3
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2.6
21
85
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41
5
0
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1.24
92071935--92072102
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54.7
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17
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30
4
3
61
1.31
92071935--92071993
23
2.5
23
78
13
57
33
5
1
59
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92072088--92072154
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22
50
34
0
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58
1.26
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140
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1
511
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4
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1.32
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0
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0
0
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35
0
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1
61
1.26
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73
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29
0
2
68
1.04
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4.1
19
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30
0
4
65
1.11
92073803--92073882
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21
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4
0
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1.22
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1.09
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2.4
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35
1
5
57
1.31
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1.8
112
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3
11
54
1.54
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275
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13
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26
1.94
92087240--92087507
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31
13
27
26
1.94
92087244--92087507
133
2.0
133
84
1
341
31
13
27
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92088970--92089024
25
2.2
25
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6
67
32
0
1
65
1.03
92088979--92089043
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2.2
28
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10
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32
4
1
61
1.26
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19
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30
0
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64
1.14
92089060--92089137
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2.4
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84
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106
29
0
3
66
1.09
92089053--92089135
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13
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28
0
3
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1.07
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73
14
59
28
0
2
68
1.04
92089053--92089126
12
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69
27
58
28
0
2
68
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4
0
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1.22
92098547--92098882
75
4.7
74
76
16
280
27
17
22
33
1.96
92098641--92098825
65
2.9
65
92
2
293
23
18
25
31
1.97
92099115--92099275
88
1.8
88
91
0
268
28
24
19
27
1.98
92100054--92100090
14
2.6
14
95
0
65
10
35
51
2
1.51
92100595--92100650
22
2.6
21
85
5
67
41
5
0
53
1.24
92100618--92100782
3
53.7
3
69
17
74
31
4
2
61
1.28
92100619--92100674
17
3.3
18
73
9
55
33
5
0
60
1.19
92100771--92100840
29
2.4
29
77
13
72
34
0
7
58
1.25
92100768--92100839
10
6.5
11
75
15
60
34
0
6
58
1.25
92100705--92101142
131
3.3
128
82
9
479
31
2
5
60
1.32
92100762--92101187
131
3.1
134
92
4
689
30
3
5
60
1.34
92101168--92101218
3
16.7
3
87
4
75
35
3
0
60
1.15
92107693--92107739
22
2.1
23
84
4
60
38
2
14
44
1.58
92109305--92109359
27
2.0
28
82
7
67
58
10
3
27
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92109341--92109378
15
2.5
15
91
4
58
73
2
0
23
0.95
92113957--92113993
18
2.1
18
100
0
74
29
37
16
16
1.90
92117092--92117323
3
76.7
3
73
5
153
61
2
6
29
1.33
92118662--92118798
60
2.3
60
85
8
172
25
25
20
28
1.99
92118661--92118762
28
3.5
27
71
19
80
24
28
20
26
1.99
92123603--92123637
18
1.9
18
88
11
54
62
0
2
34
1.10
92126117--92126180
21
3.1
21
84
10
89
51
6
21
20
1.69
92127783--92128056
46
6.0
46
90
0
397
22
22
14
39
1.91
92133480--92133558
30
2.6
30
87
0
113
31
15
15
37
1.88
92134358--92134394
20
1.9
20
88
5
58
40
0
8
51
1.32
92136550--92136914
46
8.0
46
91
1
491
38
16
24
21
1.93
92136550--92136914
183
2.0
183
86
1
516
38
16
24
21
1.93
92138136--92138199
21
3.1
21
82
10
80
50
6
21
21
1.71
92141479--92141529
25
2.0
26
84
3
68
39
1
9
49
1.47
92146475--92146543
29
2.4
29
82
2
95
27
5
7
59
1.47
92146897--92147164
90
3.0
90
98
0
511
24
15
8
51
1.71
92147351--92147594
128
1.9
128
94
0
436
25
13
23
37
1.91
92148852--92148897
19
2.4
19
89
10
67
65
4
13
17
1.42
92150054--92150114
31
2.0
31
86
0
86
42
8
8
40
1.64
92153029--92153197
46
3.5
46
75
16
146
31
28
14
25
1.94
92154279--92154362
21
4.0
21
84
6
98
38
25
22
14
1.92
92154548--92154627
28
2.8
29
86
3
117
47
32
3
16
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92162258--92162769
125
4.1
122
81
4
566
29
16
17
37
1.91
92162850--92162940
34
2.7
33
83
8
112
42
13
1
42
1.50
92165219--92165653
215
2.0
214
98
0
843
38
7
19
34
1.80
92167595--92167649
12
4.9
11
75
18
51
41
3
1
52
1.29
92169324--92169481
41
3.9
41
83
1
183
36
20
18
24
1.94
92169417--92169497
41
2.0
41
90
0
126
37
19
17
25
1.94
92169568--92169603
17
2.1
18
89
5
56
25
0
13
61
1.33
92170588--92170951
165
2.2
165
84
2
446
34
16
23
25
1.95
92178685--92178812
59
2.1
61
83
11
158
25
14
13
46
1.80
92179034--92179079
24
2.0
23
86
4
65
65
2
4
28
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325