Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  79  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27343183--27343215
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2.1
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4.3
46
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1
223
19
24
15
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
122
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3.2
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2.1
118
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24
16
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0
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0
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51
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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Entropy
(0-2)
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13
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147
2.6
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22
12
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1.9
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0
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1.8
126
86
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0
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1.00
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2.0
264
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0
941
22
15
27
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27439956--27440021
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31
1
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0
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16
2.8
15
80
16
52
41
0
0
58
0.98
27446900--27446965
29
2.2
30
83
2
80
50
6
3
40
1.43
27447300--27447338
20
2.0
20
84
0
51
43
2
2
51
1.29
27447644--27447678
18
1.9
18
100
0
70
45
17
17
20
1.85
27447768--27447805
18
2.1
18
95
0
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44
47
0
7
1.32
27447782--27447806
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
27447831--27447928
6
15.5
6
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10
133
77
5
0
17
0.94
27447836--27447928
32
2.9
32
100
0
186
77
5
0
17
0.95
27447831--27447928
26
3.9
25
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137
77
5
0
17
0.94
27447948--27448007
9
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1.82
27447948--27448015
18
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18
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1.78
27447948--27448007
27
2.2
27
84
0
84
28
10
18
43
1.82
27447956--27448015
27
2.2
27
78
0
66
31
8
15
45
1.75
27448387--27448442
20
2.8
19
72
20
51
33
1
1
62
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27450419--27450475
28
2.0
28
100
0
114
24
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47
1.79
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106
2.6
107
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3
387
47
6
10
35
1.62
27457781--27457808
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4.7
6
100
0
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0
0
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39
2.0
39
97
0
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30
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8
5.2
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14
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53
0
0
46
1.00
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2.0
15
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0
0
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16
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6
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56
0
0
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0
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0
0
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2.0
38
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0
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2.1
19
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25
1.23
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2.5
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58
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2.2
20
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54
4
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29
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5
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33
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0
2
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17
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18
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17
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60
1
2
35
1.18
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22
2.6
20
78
21
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1
3
29
1.21
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51
3.1
50
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1
251
31
15
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29
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26
4.2
25
91
4
139
35
4
23
36
1.76
27513589--27513698
52
2.1
52
89
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168
35
4
23
36
1.76
27514875--27514903
8
3.6
8
100
0
58
55
20
24
0
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27515319--27515458
27
5.2
27
86
2
174
17
25
22
34
1.96
27515319--27515458
54
2.6
55
88
2
194
17
25
22
34
1.96
27519858--27520014
51
3.1
50
91
1
251
31
15
23
29
1.95
27524065--27524107
18
2.4
18
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7
52
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4
0
48
1.22
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4.0
7
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0
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0
0
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0.86
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3
72
11
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2
5
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27528952--27529140
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2
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133
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23
21
27
1.99
27530638--27531351
143
5.0
144
85
0
885
27
21
19
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325