Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  80  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27530638--27531351
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2.5
286
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0
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2.0
20
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29
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2.0
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0
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2.7
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60
55
0
0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
23
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0
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2.0
21
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21
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0
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1.00
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208
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19
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2.9
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25
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2
41
1.27
27630893--27631000
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3.4
30
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2
38
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6
9.5
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1
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41
1.44
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19
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1.19
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24
2.1
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2.0
22
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0
39
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
23
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7
0
44
1.31
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17
2.2
18
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4
51
57
2
0
39
1.12
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10
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1
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1.19
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20
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70
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20
32
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0
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22
21
1.88
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1.90
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1.9
133
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13
22
21
1.87
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2.0
15
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0
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40
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25
1.78
27690449--27690551
34
3.1
34
62
25
85
48
17
8
25
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27690437--27690690
112
2.3
112
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0
418
47
16
12
24
1.81
27690501--27690609
48
2.3
48
91
0
182
46
14
11
26
1.79
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2.1
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15
15
24
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15
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25
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4.1
12
82
10
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57
12
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22
1.61
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18
2.4
18
80
0
50
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1.64
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2.4
29
78
17
85
21
9
20
47
1.78
27692826--27692892
10
6.7
10
78
13
66
31
0
4
64
1.14
27692831--27692892
21
3.0
20
80
11
81
29
0
3
67
1.06
27702692--27702900
44
4.5
49
75
16
171
29
16
18
35
1.93
27702974--27703217
44
5.5
44
74
4
213
28
25
19
26
1.99
27702971--27703264
88
3.3
88
80
5
335
27
23
19
28
1.99
27707221--27707264
19
2.3
20
88
7
65
43
11
22
22
1.85
27709315--27709343
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
27709330--27709396
27
2.5
26
80
7
62
71
1
5
20
1.15
27709500--27709540
18
2.4
17
83
4
55
73
7
0
19
1.07
27709504--27709543
4
9.5
4
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10
53
72
7
0
20
1.08
27713116--27713173
26
2.2
26
90
0
89
36
22
5
36
1.77
27716326--27716359
12
2.9
12
86
4
52
32
0
0
67
0.91
27721584--27721644
15
3.7
16
71
28
56
63
0
6
29
1.19
27721585--27721634
18
2.8
17
85
8
64
66
0
4
30
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27721590--27721650
18
3.5
17
75
20
56
67
0
4
27
1.11
27721750--27721825
21
3.7
20
73
23
68
65
5
9
19
1.40
27730370--27730427
26
2.2
26
93
0
98
34
5
24
36
1.78
27737329--27737366
19
2.0
19
94
0
67
7
26
15
50
1.72
27738783--27738875
32
2.8
33
84
7
102
31
13
22
32
1.93
27738811--27738926
33
3.5
33
80
6
110
34
12
22
31
1.91
27739645--27739699
12
4.3
13
76
17
53
60
5
0
34
1.20
27739796--27739840
18
2.6
17
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63
66
0
4
28
1.11
27739796--27739856
18
3.5
18
76
24
60
67
0
4
27
1.11
27747621--27747650
15
1.9
16
93
6
53
80
0
13
6
0.91
27754293--27754357
31
2.1
31
82
2
78
49
1
0
49
1.10
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21
1.9
21
84
0
53
47
0
0
52
1.00
27754305--27754366
31
2.0
32
87
3
90
48
1
0
50
1.10
27758480--27758651
93
1.8
93
98
0
335
19
18
0
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1.34
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26
2.0
24
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7
82
64
4
0
32
1.12
27764899--27764931
12
2.8
12
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4
50
75
6
0
18
1.00
27764871--27764932
26
2.6
25
80
12
67
69
4
0
25
1.08
27768805--27768974
38
4.4
38
70
18
127
43
1
4
51
1.28
27768835--27768934
45
2.1
47
81
7
114
42
0
3
55
1.15
27768948--27768979
16
2.1
16
88
11
50
50
0
6
43
1.27
27768787--27769083
117
2.5
117
95
2
517
43
1
4
51
1.28
27769337--27769378
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27769328--27769369
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
27769493--27769534
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
27769484--27769525
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
27769637--27769671
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
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157
3.0
157
97
0
881
47
4
3
44
1.40
27769907--27769974
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4.2
16
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0
127
38
38
0
23
1.55
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0
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0
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0
50
0
24
0
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0.80
27782416--27782450
17
2.0
18
88
5
54
60
0
11
28
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325