Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  117  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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29
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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59
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36872268--36872353
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0
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2
436
21
23
13
41
1.89
36890014--36890373
90
4.0
91
91
1
526
21
23
14
40
1.90
36890019--36890373
182
2.0
181
89
1
541
21
23
14
40
1.89
36893342--36893544
101
2.0
101
87
0
289
29
22
15
32
1.95
36895774--36895806
11
2.8
12
90
9
50
72
0
0
27
0.85
36895774--36895807
12
2.9
11
87
12
50
70
0
0
29
0.87
36896543--36896649
50
2.1
50
94
0
187
36
12
22
28
1.90
36896628--36896669
20
2.1
20
100
0
84
45
9
28
16
1.79
36896576--36896719
70
2.0
71
89
1
218
39
13
22
25
1.90
36896715--36896832
31
3.8
31
81
0
137
29
16
24
28
1.97
36904223--36904267
23
2.0
23
86
0
63
4
22
2
71
1.15
36908038--36908107
35
2.0
35
100
0
140
40
8
31
20
1.82
36910894--36910952
30
2.0
30
93
0
100
57
10
5
27
1.52
36918829--36918861
16
2.0
17
94
5
59
51
0
6
42
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36923970--36924008
19
2.1
19
100
0
78
35
5
20
38
1.75
36924937--36924988
26
2.0
26
100
0
104
42
23
11
23
1.86
36927399--36927426
12
2.3
12
100
0
56
32
0
28
39
1.57
36931093--36931432
49
7.0
48
75
7
220
35
16
25
23
1.95
36931137--36931348
48
4.3
48
75
9
160
34
14
27
23
1.94
36931137--36931404
99
2.7
97
78
4
261
34
16
25
24
1.95
36932122--36932167
9
5.1
9
89
10
76
45
10
10
32
1.74
36932755--36932928
86
2.0
86
95
0
312
38
6
5
48
1.54
36933173--36933197
10
2.5
10
100
0
50
12
20
20
48
1.80
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25
1.9
25
82
0
60
29
8
16
45
1.76
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15
3.5
15
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10
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0
0
36
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3
11.3
3
100
0
68
64
0
0
35
0.94
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21
3.2
21
71
20
75
41
3
15
40
1.63
36937361--36937427
22
3.3
22
72
20
81
41
2
14
40
1.62
36937359--36937435
39
2.0
39
100
0
154
40
2
15
41
1.61
36940712--36940748
16
2.4
16
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8
51
48
8
8
35
1.62
36943368--36943426
29
2.0
30
86
3
84
28
5
13
52
1.61
36946465--36946563
30
3.1
30
72
18
83
31
19
12
37
1.88
36946465--36946608
66
2.2
66
82
2
164
31
20
12
34
1.90
36949263--36949373
40
2.8
40
87
2
152
32
17
12
37
1.87
36950234--36950272
17
2.3
18
86
13
64
0
30
0
69
0.89
36950303--36950331
12
2.3
13
94
5
51
0
24
3
72
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36950489--36950515
8
3.4
8
100
0
54
62
0
0
37
0.95
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9
4.9
9
82
5
61
44
2
9
44
1.49
36955898--36956049
69
2.2
69
90
3
234
29
14
38
17
1.89
36959909--36959960
9
5.8
9
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6
52
46
1
1
50
1.23
36959957--36959996
17
2.4
16
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4
53
22
0
0
77
0.77
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22
2.0
20
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4
2
24
1.22
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19
2.0
19
100
0
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18
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180
28
26
19
25
1.98
36972913--36972958
20
2.3
20
81
3
58
30
30
15
23
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325