Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  279  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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55
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2.0
35
97
0
131
38
20
15
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89565525--89566829
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0
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20
33
1.97
89570981--89571091
50
2.2
50
82
6
136
26
18
21
33
1.97
89571036--89571096
25
2.4
25
84
10
88
29
18
21
31
1.96
89574609--89574652
22
1.9
22
86
9
61
72
13
13
0
1.12
89579563--89579596
16
2.1
16
88
0
50
23
41
0
35
1.55
89581500--89581565
6
10.5
6
75
6
51
16
1
7
74
1.12
89581495--89581564
24
3.2
21
77
16
70
17
1
7
74
1.11
89583217--89583273
27
2.1
28
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3
80
45
7
7
40
1.58
89583772--89583806
18
1.9
18
88
0
52
65
2
14
17
1.38
89584702--89584741
10
3.9
10
86
3
53
32
0
22
45
1.53
89584701--89584742
20
2.0
21
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4
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30
0
21
47
1.51
89589004--89589036
16
2.0
17
94
5
59
45
0
0
54
0.99
89590234--89590322
20
4.6
19
79
12
83
61
2
1
34
1.15
89590229--89590322
9
10.0
9
71
20
68
62
2
1
34
1.14
89590245--89590318
28
2.5
30
81
14
84
63
2
1
32
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89590229--89590321
38
2.4
39
82
8
111
62
2
1
34
1.14
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29
2.3
28
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10
73
53
4
0
41
1.21
89590968--89591060
10
10.1
9
73
15
57
37
1
2
59
1.17
89590968--89591076
18
5.8
18
71
19
80
36
0
1
60
1.14
89590953--89591048
26
3.6
26
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14
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31
2
2
64
1.16
89590968--89591076
10
11.5
10
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25
51
36
0
1
60
1.14
89591323--89591425
9
11.6
9
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32
0
4
63
1.16
89591323--89591385
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3.4
19
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31
0
4
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1.15
89593408--89593444
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2.2
17
100
0
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21
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19
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4
2
29
1.26
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1.9
15
100
0
58
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0
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20
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1
2
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1.23
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2.0
56
100
0
224
48
5
14
32
1.66
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177
2.1
177
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0
570
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1.98
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4.6
45
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30
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1.97
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133
3.0
133
92
0
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21
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29
1.97
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2
18.0
2
88
0
54
50
44
0
5
1.25
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23
2.6
24
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10
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72
0
19
8
1.09
89617219--89617279
25
2.6
22
80
16
70
70
0
19
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1.15
89617708--89617825
57
2.1
58
91
1
193
27
21
4
46
1.69
89620482--89620521
21
1.9
21
89
0
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2
15
5
77
1.04
89620741--89620782
13
3.1
14
82
3
50
66
0
4
28
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89631159--89631212
27
2.0
27
85
3
74
33
7
24
35
1.83
89633465--89633494
15
2.0
15
93
0
51
76
6
0
16
0.99
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46
5.9
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78
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243
36
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24
23
1.93
89636579--89636829
46
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45
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9
293
39
15
23
21
1.91
89636526--89636829
84
3.5
84
87
5
387
38
15
24
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1.92
89637090--89637136
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2.0
25
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4
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2.0
22
100
0
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5
0
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0
0
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19
2.0
19
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10
51
68
0
0
31
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325