Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  81  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.4
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0
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23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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17
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1.94
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19
16
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1.94
27807971--27808577
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147
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25
2.5
26
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30
1.38
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25
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0
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51
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0
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19
13
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.94
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2.0
25
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1.60
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1.9
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1.28
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18
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63
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0
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1.9
19
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2.4
58
83
0
176
45
14
13
27
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27885497--27885688
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64
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0
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14
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2.5
176
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28
1.97
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20
28
28
1.99
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93
1.9
93
90
0
274
22
20
28
27
1.99
27892840--27892905
28
2.3
28
76
12
71
66
1
4
27
1.20
27893360--27893394
17
2.1
17
89
5
54
71
0
20
8
1.11
27893350--27893436
36
2.4
36
79
12
90
65
0
24
10
1.23
27893382--27893442
30
2.0
30
81
12
72
60
0
29
9
1.29
27895249--27895338
34
2.6
34
75
5
92
36
7
14
41
1.75
27895383--27895432
9
5.4
9
83
4
64
22
2
20
56
1.53
27895402--27895432
10
3.2
10
95
4
55
19
0
19
61
1.35
27896644--27896692
9
5.1
9
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7
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2
2
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1.17
27896644--27896714
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10
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2
4
60
1.30
27900512--27900555
19
2.3
19
100
0
88
31
9
15
43
1.79
27920531--27921115
244
2.4
242
92
1
958
51
4
6
36
1.48
27922930--27922963
6
5.7
6
96
0
50
23
0
23
52
1.47
27931350--27931472
43
2.9
43
80
4
133
28
28
17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27933553--27933736
67
2.8
64
76
11
187
28
17
30
22
1.97
27939412--27939676
18
14.3
18
69
14
119
35
13
12
38
1.82
27939412--27939694
36
7.6
36
69
10
158
36
12
12
38
1.81
27939491--27939694
72
2.8
72
76
10
184
36
11
12
39
1.79
27939858--27939965
44
2.4
45
89
3
164
41
20
19
18
1.90
27939943--27939967
12
2.1
12
100
0
50
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20
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16
1.91
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16
2.4
16
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0
60
0
30
0
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0.89
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27
2.0
27
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11
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48
10
12
30
1.73
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16
2.2
18
86
9
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13
2
7
76
1.11
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19
2.9
19
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2
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45
21
0
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1.52
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15
2.1
15
100
0
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0
25
1.52
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1.9
30
83
10
75
52
0
1
45
1.10
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19
2.4
19
88
7
63
37
13
11
37
1.82
27968296--27968332
19
1.9
19
100
0
74
37
10
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35
1.83
27968296--27968355
19
2.8
22
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9
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36
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38
1.79
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18
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27
0
0
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0.85
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21
2.0
20
85
4
55
56
7
2
34
1.40
27972519--27972578
27
2.3
26
82
8
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63
3
3
30
1.27
27972572--27972596
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
0.63
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23
2.1
23
88
7
71
54
6
4
35
1.45
27972588--27972634
21
2.1
22
88
7
69
55
6
4
34
1.45
27973635--27973667
16
2.1
16
100
0
66
36
0
12
51
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27973715--27973776
21
3.0
20
78
4
61
61
3
3
32
1.28
27973842--27973886
14
3.0
15
77
9
56
28
8
15
46
1.76
27973843--27973889
15
3.1
15
73
8
51
31
8
14
44
1.76
27974029--27974078
23
2.3
23
82
6
59
30
2
10
58
1.42
27974148--27974180
15
2.1
16
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5
50
39
6
0
54
1.25
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3
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3
100
0
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0
0
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0.91
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32
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3
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13
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2
0
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25
100
0
100
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12
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24
1.79
28015920--28015961
19
2.2
20
91
4
68
35
4
28
30
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325