Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  304  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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249
29
16
3
49
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96654308--96654459
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2.0
22
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79
0.93
96679321--96679384
32
2.0
32
100
0
128
43
28
3
25
1.69
96679321--96679375
18
3.3
18
70
19
64
45
29
3
21
1.69
96691010--96691059
23
2.2
23
82
7
57
42
12
0
46
1.41
96695484--96695528
20
2.3
19
81
7
54
44
2
0
53
1.13
96706562--96706590
14
2.0
15
93
6
51
37
6
20
34
1.80
96707188--96707309
60
2.0
60
96
0
226
48
15
9
27
1.75
96708497--96708555
19
2.8
20
76
16
57
35
6
15
42
1.73
96708508--96708550
23
1.9
23
85
4
61
37
4
16
41
1.69
96713620--96713670
19
2.9
17
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11
66
37
9
17
35
1.83
96714709--96714772
21
3.2
21
62
20
55
32
15
17
34
1.91
96714707--96714785
39
2.0
39
100
0
158
36
12
17
32
1.88
96714721--96714784
21
3.2
21
62
20
55
34
12
20
32
1.90
96719509--96719939
214
2.0
217
85
4
595
43
15
16
25
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96722701--96722759
18
3.3
17
79
9
64
49
11
6
32
1.66
96724094--96724129
18
2.0
18
88
0
54
47
2
2
47
1.31
96725651--96725679
14
2.1
14
100
0
58
41
24
13
20
1.89
96727782--96727866
42
2.0
42
100
0
170
23
14
14
48
1.80
96741377--96741427
23
2.2
23
92
0
84
33
29
13
23
1.93
96746780--96746813
3
11.7
3
87
6
52
29
2
0
67
1.05
96747350--96747380
16
1.9
16
93
0
53
35
6
3
54
1.42
96759637--96759922
46
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44
73
14
197
32
21
19
26
1.97
96761559--96761592
3
11.7
3
87
6
52
29
2
0
67
1.05
96762130--96762160
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1.9
16
93
0
53
35
6
3
54
1.42
96772285--96772741
131
3.5
131
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383
27
18
19
35
1.95
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43
1.9
43
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105
40
0
6
53
1.26
96776827--96776909
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2.0
41
81
9
96
40
0
6
53
1.26
96800909--96800965
28
2.0
29
83
10
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15
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19
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1.74
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22
3.2
22
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72
25
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27
1.98
96812595--96812661
28
2.3
29
77
10
75
29
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25
26
1.98
96812642--96812698
28
2.0
29
89
3
89
35
15
22
26
1.94
96826511--96826554
22
2.0
22
82
8
54
68
27
2
2
1.14
96826524--96826573
11
4.5
11
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16
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74
20
0
6
1.03
96827735--96827771
16
2.2
17
90
9
58
10
13
8
67
1.41
96827729--96827774
18
2.5
19
80
20
62
13
13
6
67
1.41
96829338--96829533
82
2.3
84
92
4
315
25
14
22
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96833363--96833387
3
8.3
3
100
0
50
32
36
32
0
1.58
96839276--96839329
28
1.9
28
82
14
67
46
3
3
46
1.38
96841847--96841895
18
2.7
18
81
6
55
44
14
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36
1.64
96841875--96841931
26
2.2
27
87
9
91
31
14
15
38
1.87
96841882--96841932
26
2.0
26
96
0
93
33
15
15
35
1.90
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2.3
26
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0
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1.91
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2.1
18
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0
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100
0
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0
0
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0.98
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36
1.9
35
85
8
93
60
11
5
22
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325