Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  63  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22640125--22640151
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0
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24
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2.3
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2.0
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0
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20
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30
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
5
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0.85
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3
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0
0
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3
0
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11
1.08
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3.2
12
83
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2.1
17
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52
29
23
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1.78
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2.6
31
87
0
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28
11
16
43
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
1.84
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29
3.6
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81
31
12
17
38
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2.2
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0
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0
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
34
15
50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22841325--22841387
16
4.0
16
75
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53
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41
1.22
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5
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0
0
46
1.00
22855050--22855124
12
6.1
13
74
14
61
53
0
0
46
1.00
22858646--22858678
4
8.2
4
100
0
66
48
24
0
27
1.51
22861659--22861722
26
2.5
25
82
12
69
60
7
0
31
1.25
22862634--22862671
17
2.2
17
86
9
51
36
0
2
60
1.11
22862632--22862682
9
5.7
9
83
9
52
37
0
3
58
1.16
22862685--22862733
25
1.9
25
87
4
71
28
4
4
63
1.31
22866565--22866626
13
4.8
13
83
0
61
35
8
22
33
1.84
22893466--22893490
5
5.0
5
100
0
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0
0
20
0.72
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27
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67
3
0
28
1.07
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19
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18
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9
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2
0
31
1.04
22905635--22905666
13
2.5
13
100
0
64
21
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18
15
1.87
22909420--22909459
19
2.2
19
86
4
55
50
10
0
40
1.36
22916398--22916423
11
2.4
11
100
0
52
69
0
23
7
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22919730--22919772
3
14.3
3
85
0
59
0
39
2
58
1.11
22924228--22924301
29
2.4
29
88
6
112
37
8
12
41
1.72
22938838--22938881
21
2.1
21
91
0
70
29
4
4
61
1.36
22938926--22939011
34
2.6
33
79
13
97
44
1
1
53
1.15
22938935--22939029
22
4.2
23
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20
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41
0
1
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1.05
22939022--22939047
7
3.7
7
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0
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15
0
0
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0.62
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57
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0
229
42
25
13
18
1.86
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2.9
26
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2
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53
8
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1.56
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2
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2
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7
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0
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0
51
1.00
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2.0
22
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0
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11
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29
1.32
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19
1.9
19
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2
0
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1.14
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25
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16
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62
0
1
35
1.11
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17
2.2
17
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4
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72
5
0
21
1.04
22984590--22984637
20
2.6
19
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12
55
37
6
2
54
1.38
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3.9
18
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36
4
1
58
1.26
22991965--22992025
29
2.0
31
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45
4
21
27
1.72
22994167--22994255
46
1.9
46
100
0
178
35
12
24
26
1.91
22994203--22994301
30
3.2
30
65
29
82
36
14
24
25
1.93
22994233--22994271
16
2.4
16
100
0
78
35
15
25
23
1.94
22994187--22994317
62
2.1
62
100
0
262
36
13
24
25
1.92
22994249--22994595
46
7.5
46
89
1
493
41
14
23
21
1.89
22994167--22994363
108
1.8
108
95
2
360
37
12
24
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22994881--22994913
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
22996429--22996492
32
2.0
32
96
0
119
31
26
18
23
1.98
22997915--22998035
51
2.4
51
90
0
179
27
23
16
32
1.96
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12
2.4
12
100
0
58
20
0
6
72
1.07
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2.0
85
100
0
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29
14
14
41
1.85
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3.0
25
100
0
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19
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0
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0
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0
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0
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6
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0
33
0
0.92
23017931--23017963
15
2.2
15
100
0
66
36
0
24
39
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325