Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  230  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72503566--72503617
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17
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32
1
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0
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2.3
29
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19
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20
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2.0
23
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2.1
18
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3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
72535710--72535821
28
4.0
27
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98
28
12
25
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1.92
72537485--72537533
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21
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2.0
15
100
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30
16
16
37
1.91
72548490--72548616
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2.4
54
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2
184
32
14
15
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1.89
72548507--72548605
18
5.5
18
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146
30
16
16
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1.90
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11
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10
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1.01
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2.0
21
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24
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120
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29
19
21
1.97
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3.6
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200
29
28
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1.98
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2.9
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29
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1.98
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19
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3.4
24
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23
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1.50
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1.98
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4.2
8
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3
50
48
15
0
36
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
15
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51
0
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1.07
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25
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5
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2
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1.26
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4
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2
25
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1.20
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29
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1.92
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1.70
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2.8
12
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0
50
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72615208--72615244
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0
18
0
0.70
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2.4
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0
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0
18
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1.28
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0
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0
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41
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4
230
14
15
28
42
1.86
72648351--72648510
82
2.0
82
83
2
205
16
16
26
41
1.89
72648354--72648532
82
2.2
82
80
2
189
17
15
25
41
1.89
72655479--72655527
25
2.0
25
91
0
80
32
16
14
36
1.89
72661944--72662002
24
2.5
24
88
2
84
22
15
27
35
1.94
72662020--72662151
25
5.3
25
73
5
108
30
22
20
26
1.98
72662011--72662151
49
2.8
50
84
4
169
29
21
20
27
1.98
72673831--72673936
40
2.7
40
92
0
176
22
18
29
29
1.98
72676274--72676318
18
2.5
17
92
7
72
40
22
17
20
1.92
72681334--72681517
40
4.6
40
92
2
289
21
14
28
34
1.93
72686707--72686843
10
14.7
9
69
14
57
63
0
4
31
1.19
72686716--72686788
26
2.6
28
82
8
87
63
0
2
34
1.09
72686716--72686792
29
2.8
27
80
15
86
62
0
2
35
1.09
72686809--72686885
40
2.0
40
82
12
97
62
1
6
29
1.28
72687059--72687096
19
2.0
19
89
0
58
23
5
2
68
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72687060--72687102
19
2.2
20
83
4
52
25
4
2
67
1.22
72687099--72687130
10
3.2
10
95
0
55
28
12
0
59
1.34
72687154--72687191
19
2.0
20
89
5
60
42
0
0
57
0.98
72687070--72687225
9
16.4
9
67
15
57
29
4
2
63
1.27
72687349--72687585
92
2.6
88
80
9
246
32
9
18
38
1.83
72689697--72689771
29
2.6
29
95
0
132
22
14
22
40
1.91
72689810--72689846
16
2.2
17
85
9
58
27
10
29
32
1.90
72689817--72689847
16
1.9
16
100
0
62
29
12
32
25
1.93
72693581--72693622
19
2.2
20
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4
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71
0
21
7
1.09
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3.6
40
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4
193
25
24
26
23
2.00
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2.0
13
100
0
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7
0
46
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2.0
21
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40
2
2
54
1.26
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6
4.2
6
100
0
50
84
0
16
0
0.63
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3.8
46
78
10
196
21
19
27
30
1.98
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1.8
93
92
0
290
22
20
27
29
1.98
72728489--72728635
40
3.7
40
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5
120
25
27
21
25
2.00
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80
2.3
80
83
9
219
27
27
20
23
1.99
72728532--72728715
40
4.6
40
81
7
196
28
27
20
23
1.99
72733309--72733530
118
1.9
119
84
6
299
25
27
22
24
2.00
72733288--72733530
40
6.1
40
84
7
291
25
27
22
24
2.00
72734654--72734771
54
2.1
56
95
3
213
22
22
9
45
1.80
72741275--72741405
41
3.1
41
62
21
99
41
6
24
27
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72741236--72741414
85
2.1
85
97
0
340
37
8
27
25
1.85
72743610--72744023
47
8.6
47
89
4
612
33
7
29
29
1.85
72743610--72744023
96
4.3
96
94
1
688
33
7
29
29
1.85
72743610--72744012
145
2.8
145
90
4
618
33
7
29
29
1.86
72745286--72745510
40
5.7
40
84
5
260
25
27
21
24
1.99
72745251--72745510
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3.3
80
81
6
262
25
26
21
26
1.99
72745288--72745510
119
1.9
120
82
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283
25
27
21
25
2.00
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2.1
23
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0
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2.2
47
96
0
192
34
7
30
27
1.85
72756794--72756989
40
4.9
40
87
0
302
20
23
29
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325