Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  167  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52861388--52861455
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21
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2
17
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3.2
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28
1.96
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28
3.0
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27
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1.96
52874915--52874969
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22
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1
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2
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20
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1
19
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76
0.97
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1.9
36
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106
2
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1
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2
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52896293--52896333
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2
2
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0.92
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39
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2.0
18
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0
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284
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1.9
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100
0
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2.1
29
87
0
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43
28
0
28
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52919581--52919907
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1.9
174
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0
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1.94
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24
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52927552--52927769
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52934245--52934277
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2.1
16
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110
24
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29
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2.0
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100
0
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2.2
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100
0
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48
0
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16
2.0
16
100
0
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37
12
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1.68
52993830--52993868
17
2.3
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2.4
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21
1.47
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40
4.7
40
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28
21
24
1.99
53014556--53014740
79
2.3
80
78
8
198
25
28
21
24
1.99
53020317--53020431
55
2.1
56
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137
35
21
23
19
1.96
53020350--53020431
27
3.0
27
85
7
112
31
21
25
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.4
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202
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22
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1.95
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15
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0
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1.50
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24
1.98
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6
19.3
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1.82
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110
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19
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53034630--53034740
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3.6
31
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140
47
13
18
19
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2.7
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47
13
19
18
1.82
53034631--53034712
19
4.4
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25
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17
18
1.84
53041015--53041081
19
3.6
19
80
11
84
52
16
14
16
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53040998--53041082
37
2.3
37
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1.78
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27
3.0
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20
23
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1.96
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483
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19
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244
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8
20
39
1.82
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17
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1.80
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13
3.5
13
82
17
65
47
9
20
22
1.78
53044130--53044217
25
3.6
25
87
4
126
48
14
18
18
1.81
53044335--53044399
27
2.4
27
82
5
69
32
23
23
21
1.98
53044667--53045051
27
14.3
27
85
2
486
25
20
20
34
1.97
53045087--53045320
27
8.7
27
83
4
251
29
9
23
37
1.87
53045144--53045320
79
2.2
80
87
2
248
29
9
22
38
1.86
53051379--53051443
32
2.0
32
96
0
121
27
18
20
33
1.96
53064034--53064229
40
4.9
40
91
2
313
23
27
22
26
2.00
53072080--53072266
40
4.7
40
84
5
220
24
25
22
27
2.00
53085839--53087173
325
4.1
325
86
3
1849
37
17
9
35
1.82
53085839--53087173
651
2.0
652
88
2
2000
37
17
9
35
1.82
53088083--53088133
21
2.5
21
87
3
68
68
5
7
17
1.34
53090663--53090695
17
1.9
17
93
0
57
78
0
21
0
0.75
53090704--53090748
20
2.3
19
88
11
65
68
0
20
11
1.19
53094501--53094597
30
3.2
30
76
2
106
27
27
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53097656--53097693
17
2.2
18
85
4
51
63
2
23
10
1.39
53097675--53097729
12
4.6
12
76
13
51
65
0
21
12
1.26
53101065--53101106
11
3.4
13
81
18
54
78
7
2
11
1.04
53101065--53101094
13
2.3
13
94
0
51
83
6
0
10
0.81
53101065--53101107
12
3.7
12
87
12
54
76
6
2
13
1.08
53101076--53101118
11
3.6
12
90
6
61
72
6
6
13
1.27
53102145--53102215
30
2.4
31
81
11
85
60
0
25
14
1.34
53104306--53104402
30
3.2
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26
1.96
53106610--53106657
20
2.4
20
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0
51
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18
27
20
1.96
53108297--53108328
12
2.7
12
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0
55
18
21
0
59
1.38
53108310--53108371
27
2.3
27
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10
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9
19
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1.25
53108312--53108370
14
4.3
14
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16
52
10
16
1
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1.22
53109483--53109534
15
3.5
15
75
15
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3
13
5
76
1.10
53109464--53109546
30
2.8
29
80
8
87
8
15
4
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1.28
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30
3.2
30
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2
106
28
26
14
29
1.95
53115778--53115818
11
3.5
11
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70
7
4
17
1.28
53115798--53115835
19
2.1
19
85
9
53
73
5
7
13
1.22
53116732--53116799
21
3.2
20
80
12
66
76
4
17
1
1.03
53116743--53116799
5
11.0
5
77
17
55
77
3
17
1
1.00
53116743--53116799
16
3.7
14
80
17
60
77
3
17
1
1.00
53116868--53116892
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
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1.02
53116862--53116917
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53116868--53116949
30
2.7
31
81
5
105
64
1
21
12
1.33
53120056--53120152
30
3.2
31
73
5
101
27
28
15
27
1.96
53125751--53125806
21
2.7
21
72
5
51
8
17
1
71
1.21
53125750--53125806
14
4.1
14
75
16
57
8
17
1
71
1.19
53125768--53125882
18
6.4
18
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14
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7
18
2
71
1.22
53125768--53125869
6
16.7
6
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9
64
6
17
2
72
1.19
53125828--53125894
12
5.8
12
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10
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8
17
2
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1.27
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29
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1.12
53126947--53127007
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0
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14
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1.19
53130741--53130837
30
3.2
30
70
11
83
27
27
15
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325