Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  34  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
13020847--13020887
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0
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1.27
13031460--13031514
28
2.0
27
86
10
76
50
1
1
45
1.22
13031489--13031533
16
2.5
19
79
17
51
46
2
0
51
1.13
13031487--13031538
20
2.6
19
79
11
52
50
1
0
48
1.12
13032773--13032902
51
2.6
51
83
1
154
29
28
16
25
1.97
13032767--13032902
50
2.7
50
81
1
164
28
27
18
25
1.98
13038951--13038993
21
2.0
21
82
8
52
23
20
4
51
1.66
13040033--13040125
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
13040269--13040330
25
2.6
24
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12
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32
25
0
41
1.56
13040269--13040326
24
2.4
25
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11
77
31
27
0
41
1.56
13040476--13040519
18
2.4
18
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0
70
54
9
0
36
1.32
13040477--13040517
12
3.4
12
93
0
64
56
7
0
36
1.27
13041225--13041259
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
13041262--13041325
31
2.2
29
80
8
76
48
1
1
48
1.20
13042593--13042729
51
2.7
51
83
1
177
28
27
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13042581--13042728
50
2.9
50
82
1
197
27
27
18
25
1.98
13044718--13044743
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
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22
2.0
22
85
0
59
41
11
23
23
1.87
13068459--13068484
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
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6
4.2
6
100
0
50
16
0
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52
1.44
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3
14.3
3
85
0
50
55
0
9
34
1.32
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2.2
35
100
0
152
36
2
14
46
1.59
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12
4.1
12
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0
6
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1.25
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24
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1
6
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1.37
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9
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0
50
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0
38
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2.1
16
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10
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0
0
25
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95
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2
277
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12
25
1.90
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17
2.4
16
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50
2
0
47
1.14
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2.0
21
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0
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21
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2.3
23
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34
1.77
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28
2.0
28
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40
1.44
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7
5.7
7
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8
64
15
0
55
30
1.41
13107012--13107051
20
1.9
22
90
10
66
15
0
55
30
1.41
13108961--13109072
22
5.0
22
74
22
90
14
1
28
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1.49
13108993--13109039
21
2.2
21
92
3
76
6
0
27
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1.16
13108969--13109038
21
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21
80
15
72
10
1
28
60
1.38
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3
28.3
3
73
19
65
30
3
1
65
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13109369--13109455
27
3.4
27
71
19
78
29
3
1
65
1.16
13109370--13109459
18
4.7
18
80
13
92
31
3
1
64
1.17
13111810--13111862
5
10.0
5
80
11
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41
0
1
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1.10
13111807--13111863
8
6.6
9
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22
59
43
0
1
54
1.10
13111808--13111863
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
13113178--13113216
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2.1
19
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4
62
41
0
10
48
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39
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112
23
20
28
28
1.99
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2.2
19
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0
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41
0
1
56
1.10
13118249--13118305
8
6.6
9
74
22
59
43
0
1
54
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325