Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  282  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90315327--90315360
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0
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19
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380
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18
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1.98
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2.7
132
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18
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1.95
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3.8
131
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19
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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15
22
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90398575--90398631
5
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2.2
37
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23
9
0
66
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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571
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13
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1.42
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11
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11
0
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1.30
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50
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1.95
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2.3
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4
57
41
31
2
24
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90463946--90463984
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40
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3.0
48
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0
205
19
14
30
35
1.92
90502733--90502916
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
90502733--90502913
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
90502814--90502963
40
3.8
38
80
10
131
25
22
28
24
1.99
90506901--90507170
129
2.1
130
96
2
499
27
17
27
27
1.98
90508081--90508281
99
2.0
101
92
3
336
29
24
20
24
1.99
90510532--90510714
40
4.6
40
81
8
187
24
20
26
28
1.99
90510532--90510711
80
2.3
81
83
10
212
23
21
27
27
1.99
90513542--90513726
41
4.5
41
75
12
123
33
24
15
26
1.95
90513542--90513726
82
2.2
84
81
10
213
33
24
15
26
1.95
90513587--90513725
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3.4
40
77
10
131
31
25
15
26
1.96
90516692--90516762
35
2.0
35
94
0
124
22
5
18
53
1.65
90522605--90522740
30
4.5
30
81
3
166
24
25
26
24
2.00
90522605--90522740
60
2.3
60
94
0
236
24
25
26
24
2.00
90523657--90523699
21
2.0
21
95
0
77
27
0
37
34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90523680--90523712
16
2.1
16
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0
57
33
0
36
30
1.58
90523691--90523785
45
2.1
44
88
1
136
34
5
27
32
1.79
90523947--90523981
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
90523905--90523977
27
2.7
27
76
8
76
52
2
0
45
1.15
90523866--90524137
144
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147
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2
3
46
1.35
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2.0
17
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54
0
0
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2.4
11
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0
52
19
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7
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1.43
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2
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1.97
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2.6
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0
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1.43
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14
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61
9
9
20
1.54
90536881--90536943
31
2.0
31
100
0
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9
9
19
1.53
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2.9
10
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5
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16
0
10
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1.09
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16
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15
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4
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13
2
0
83
0.76
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2.1
25
100
0
104
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15
21
1.93
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2.3
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2
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34
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1.95
90552908--90552954
23
2.1
22
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78
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6
8
1.08
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1.9
190
99
0
717
34
19
19
26
1.95
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14
2.9
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11
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57
7
13
21
1.60
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40
3.6
40
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0
173
24
24
26
24
2.00
90577139--90577163
13
1.9
13
100
0
50
12
40
32
16
1.84
90583515--90583719
27
7.6
27
86
3
259
26
15
27
30
1.96
90583516--90583719
109
1.9
108
89
3
320
26
15
27
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90591804--90592008
27
7.6
27
86
3
259
26
15
27
30
1.96
90591805--90592008
109
1.9
108
89
3
320
26
15
27
30
1.96
90593565--90593665
7
13.9
7
69
25
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45
0
0
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1.14
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46
0
0
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1.00
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0
0
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0.99
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0
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0
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0
0.83
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8
4.4
8
88
3
52
41
20
8
29
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325