Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  124  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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40
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4
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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16
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6
25
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2.0
204
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100
0
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1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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(0-2)
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148
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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25
1.86
38843354--38843391
19
1.9
19
94
5
67
73
0
5
21
1.02
38844526--38844563
7
5.0
8
81
12
53
65
0
0
34
0.93
38844520--38844563
15
2.9
15
86
0
70
68
0
0
31
0.90
38844519--38844581
22
2.9
22
71
4
56
66
0
0
33
0.92
38851331--38851390
27
2.1
27
84
9
75
26
0
5
68
1.10
38859438--38859484
24
2.0
24
87
4
69
63
2
4
29
1.25
38860231--38860281
16
3.3
15
78
8
57
62
1
1
33
1.17
38860284--38860325
14
2.9
14
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50
78
7
4
9
1.08
38866549--38866789
132
1.8
132
80
1
286
29
21
19
30
1.97
38866759--38867060
132
2.3
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30
19
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36
1.91
38868590--38868637
19
2.5
19
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0
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22
18
14
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1.87
38872667--38873075
88
4.7
88
94
0
703
26
16
28
28
1.97
38872759--38872988
41
5.3
41
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19
108
26
16
29
28
1.97
38872712--38873035
47
7.3
47
63
21
178
26
16
27
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38873037--38873453
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44
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0
582
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30
24
1.96
38872667--38873318
176
3.7
176
85
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561
27
16
28
28
1.97
38873037--38873674
132
4.9
132
83
7
736
28
15
30
24
1.96
38873429--38873493
28
2.2
28
89
5
94
21
15
33
29
1.94
38873454--38873685
44
5.2
44
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3
241
31
14
28
25
1.95
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116
1.9
116
90
3
353
27
16
32
24
1.96
38873294--38873607
160
2.0
161
86
0
441
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15
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25
1.96
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279
31
14
28
25
1.95
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11
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0
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2.5
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351
27
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1.93
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0
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16
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3
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0
89
30
0
2
67
1.02
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15
4.1
14
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6
75
29
0
1
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22
2.2
22
88
0
71
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24
22
18
1.96
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14
2.3
15
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50
15
24
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1.63
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11
2.8
11
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26
0
0
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0.84
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25
2.6
22
83
16
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54
3
1
40
1.26
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25
2.0
25
100
0
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57
4
0
38
1.18
38895781--38895815
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.5
13
100
0
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43
21
9
25
1.82
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206
4.7
206
90
0
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29
22
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30
1.97
38901416--38901462
11
4.2
11
82
12
60
0
21
0
78
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38901408--38901454
24
2.0
24
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4
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2
29
0
68
1.02
38912547--38912600
20
2.8
19
75
8
56
59
0
1
38
1.08
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16
2.1
17
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62
0
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3.4
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100
0
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0
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28
2.1
28
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0
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15
15
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1.73
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12
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0
0
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100
0
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20
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19
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1.63
38932307--38932355
18
2.8
18
77
17
50
34
18
2
44
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325