Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  73  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25672382--25672424
10
4.4
10
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5
52
0
23
0
76
0.78
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19
2.7
18
82
14
57
0
32
0
67
0.91
25672489--25672539
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3.1
17
81
13
63
0
33
0
66
0.92
25672783--25672899
30
3.9
29
77
11
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44
3
22
29
1.69
25672798--25672899
30
3.4
30
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2
134
44
3
22
29
1.71
25672895--25672928
14
2.4
15
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26
0
2
70
1.01
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9
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37
17
16
28
1.92
25673170--25673378
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2.0
104
90
4
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36
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16
28
1.92
25673365--25673399
14
2.5
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90
0
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60
2
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20
1.49
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15
1.9
15
100
0
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6
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1.26
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290
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19
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2.1
16
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36
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18
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1.94
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79
9
207
36
19
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1.90
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190
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2
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1.92
25695330--25695364
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2
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82
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52
62
6
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31
2.3
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38
1.71
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0
1
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0.97
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81
16
68
26
0
1
71
0.95
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27
2.1
28
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55
1
20
22
1.53
25709388--25709486
49
2.0
48
84
5
128
31
28
15
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25709586--25709703
31
3.8
31
88
4
175
24
27
19
27
1.99
25709679--25709807
50
2.5
51
87
5
181
25
20
16
37
1.93
25713480--25713539
19
3.1
19
75
4
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43
1
8
46
1.43
25714364--25714393
12
2.6
12
94
5
53
53
0
6
40
1.27
25719633--25719677
20
2.2
20
88
0
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35
13
2
48
1.54
25722489--25722645
43
3.7
44
79
12
166
31
26
19
22
1.98
25722489--25722645
86
1.8
85
82
6
201
31
26
19
22
1.98
25725503--25725623
43
2.8
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2
154
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13
26
1.92
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5
5.4
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8
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25732673--25732712
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1.9
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2
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24
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1.79
25736293--25736400
26
4.2
26
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4
184
36
24
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1.79
25742100--25742183
26
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26
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0
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2
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2.0
27
100
0
110
29
14
10
45
1.79
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1.9
13
100
0
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32
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0
60
1.26
25748743--25748917
46
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46
78
13
205
29
29
20
20
1.98
25748751--25748921
93
1.8
93
93
0
297
28
29
21
20
1.98
25756513--25756553
20
2.0
20
85
0
55
26
21
17
34
1.95
25756518--25756591
20
3.7
20
78
8
62
27
16
17
39
1.91
25756603--25756681
41
1.9
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86
2
115
15
25
17
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15
2.1
15
93
0
53
77
0
12
9
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
42
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2
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3
0
37
1.16
25764350--25764387
14
2.7
14
91
0
58
36
7
18
36
1.80
25764371--25764414
19
2.2
20
96
4
81
27
11
11
50
1.72
25764498--25764574
14
5.6
14
67
23
56
40
2
2
54
1.28
25764502--25764584
27
3.1
26
91
5
130
38
2
2
56
1.25
25774833--25774880
24
2.0
25
87
4
71
31
0
2
66
1.03
25774842--25774883
11
3.3
13
77
16
52
28
0
2
69
1.01
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20
2.3
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11
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60
2
2
34
1.21
25779815--25779862
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4.9
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2
2
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1.18
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18
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50
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21
29
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50
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2
1
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1.22
25808744--25808794
22
2.3
22
79
0
66
60
9
9
19
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25809012--25809038
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0
0
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2.0
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13
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2
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0
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1.00
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52
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20
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22
60
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23
1
61
1.41
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20
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0
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17
12
24
1.82
25835080--25835114
17
2.1
17
88
0
52
22
8
2
65
1.34
25835592--25835624
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
25835885--25836077
46
4.2
46
83
4
133
20
24
14
40
1.89
25835905--25836175
46
5.9
46
89
0
364
21
24
14
39
1.90
25842854--25842890
9
4.1
9
92
0
65
45
13
10
29
1.77
25854389--25854419
3
10.3
3
100
0
62
32
0
0
67
0.91
25857453--25857519
31
2.3
28
80
14
82
49
10
5
34
1.62
25864363--25864420
29
2.0
29
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80
18
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0
34
1.50
25864776--25864822
17
2.8
17
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53
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28
1.98
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21
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0
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15
2.0
15
100
0
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26
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25876771--25877198
43
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43
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13
241
27
23
19
30
1.98
25876731--25877210
174
2.8
174
96
0
863
27
23
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25876731--25877199
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5.4
87
70
6
383
27
23
18
30
1.98
25877503--25877629
46
2.8
46
83
4
143
26
19
20
33
1.97
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14
1.9
14
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0
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0
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1.30
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23
2.5
22
77
11
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5
30
32
1.80
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23
2.0
23
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1.82
25895065--25895135
37
2.0
37
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2
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1.64
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2.1
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20
20
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1.97
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2.1
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0
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0
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3.8
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1.97
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43
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1.96
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1.9
13
100
0
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2.5
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2
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29
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35
1.75
25920480--25920529
23
2.2
22
85
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30
2
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1.69
25921139--25921255
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3.0
39
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3
20
29
1.67
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2.0
42
100
0
170
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15
21
40
1.91
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4.2
6
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0
50
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0
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1.44
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26
2.0
26
100
0
106
39
3
26
30
1.74
25940611--25940657
3
15.7
3
91
8
78
29
0
0
70
0.88
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12
2.1
12
100
0
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20
24
16
1.91
25943308--25943462
43
3.6
43
95
0
283
30
33
25
10
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25943295--25943483
86
2.2
85
91
1
299
29
33
23
12
1.92
25943455--25943538
38
2.2
38
89
0
132
30
27
21
20
1.98
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2.4
96
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2
328
22
29
20
26
1.98
25952500--25952822
144
2.2
143
80
4
364
24
29
18
27
1.98
25952489--25952822
48
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48
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264
24
29
18
26
1.98
25958561--25958628
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2.8
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1.43
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2.1
22
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0
2
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20
20
1.97
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93
95
0
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30
20
20
1.98
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9
2.8
9
100
0
50
24
44
0
32
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325