Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  31  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11614657--11614770
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18
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0
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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29
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2.0
15
93
0
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40
0
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14
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11797450--11797816
98
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34
14
22
28
1.93
11797464--11797816
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1.8
196
92
0
607
34
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22
28
1.93
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14
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28
1.93
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4.0
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233
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24
1.93
11797780--11797924
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2.0
72
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229
37
15
22
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
39
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2
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1.64
11798981--11799133
79
1.9
79
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2
245
32
19
2
45
1.64
11799148--11799196
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2.0
24
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32
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13
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0
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7
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1.12
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85
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26
22
14
1.93
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5
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22
2.1
23
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4
21
4
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1.22
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18
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1.22
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1.49
11863207--11863253
17
2.6
19
76
10
53
27
0
6
65
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11867250--11867317
34
2.0
34
100
0
136
41
14
14
29
1.86
11885528--11885556
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51
0
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0
0
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0
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0.88
11923610--11923706
42
2.3
43
87
7
146
7
26
7
58
1.51
11924518--11924591
31
2.5
30
82
4
78
32
4
13
50
1.60
11924969--11925029
31
2.0
29
87
6
86
27
16
13
42
1.85
11938709--11938773
28
2.3
27
77
12
69
50
1
4
43
1.32
11940031--11940300
46
5.9
46
87
2
337
19
23
14
42
1.88
11940031--11940302
91
3.0
92
85
1
366
19
23
14
41
1.89
11940031--11940293
137
1.9
137
85
1
366
19
23
15
42
1.89
11942286--11942333
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
11943210--11943251
18
2.3
18
95
0
75
59
0
0
40
0.97
11944558--11944612
27
2.1
27
93
3
94
50
3
7
38
1.48
11946068--11946282
78
2.8
78
87
3
308
32
21
13
32
1.92
11946247--11946381
40
3.4
39
84
3
171
35
22
13
28
1.92
11951248--11951420
46
3.7
46
79
10
199
21
20
27
30
1.98
11951245--11951415
93
1.8
93
92
0
288
21
20
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11958417--11958442
6
4.3
6
100
0
52
30
30
19
19
1.96
11959765--11959804
20
2.0
19
90
9
62
35
5
10
50
1.58
11964005--11964073
31
2.2
31
79
5
77
63
2
1
31
1.18
11968157--11968190
12
2.9
12
86
4
52
67
0
0
32
0.91
11970055--11970101
21
2.2
21
88
0
67
61
0
36
2
1.08
11970478--11970571
35
2.7
35
90
3
111
44
2
14
38
1.58
11970487--11970571
19
5.0
15
78
21
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42
2
15
40
1.60
11970489--11970578
20
5.0
19
77
20
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3
14
40
1.62
11970489--11970571
35
2.4
35
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0
157
43
2
14
39
1.58
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18
3.6
18
80
0
65
42
14
12
31
1.82
11970950--11971009
18
3.4
18
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4
77
41
11
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33
1.80
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2
22.0
2
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0
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0
52
0
47
1.00
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15
7.2
15
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12
78
44
7
22
25
1.79
11980861--11980986
30
4.2
30
92
2
200
43
6
23
26
1.77
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22
2.3
22
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10
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29
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1
58
1.41
11982245--11982492
131
1.9
132
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385
28
20
19
31
1.97
11982245--11982526
131
2.1
132
84
3
372
30
19
17
32
1.95
11984785--11984851
10
6.5
10
74
16
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56
0
0
43
0.99
11984783--11984851
21
3.3
20
77
15
77
56
0
0
43
0.99
11985249--11985282
18
1.9
17
88
5
50
64
0
2
32
1.08
11992831--11992864
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2.0
17
88
0
50
38
23
0
38
1.55
11994488--11994547
8
7.1
8
79
7
57
56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11994487--11994546
9
6.9
9
76
14
54
56
0
0
43
0.99
11994497--11994553
26
2.1
28
90
6
91
56
0
0
43
0.99
11994500--11994552
19
2.9
19
84
13
60
60
0
0
39
0.97
11995385--11995411
13
2.1
13
100
0
54
29
29
22
18
1.97
11995798--11995822
12
2.1
12
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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5
5.2
5
100
0
52
38
19
0
42
1.51
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2.7
30
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16
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1
1
46
1.17
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2.2
28
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4
50
1.40
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6
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19
0
0
80
0.71
12024586--12024643
27
2.1
27
81
12
66
44
0
1
53
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325