Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  40  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14740672--14740766
43
2.2
45
90
3
149
42
17
16
23
1.89
14740744--14740768
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
14741824--14741875
13
3.9
13
82
7
61
13
9
1
75
1.14
14742143--14742208
20
3.2
20
71
18
55
50
1
1
46
1.20
14742168--14742270
36
2.8
35
74
15
91
55
1
1
40
1.22
14742774--14742840
31
2.1
33
88
5
102
16
8
31
43
1.79
14743336--14743377
20
2.2
20
87
12
61
30
4
7
57
1.47
14743511--14743549
19
2.0
20
85
5
53
38
2
7
51
1.44
14744135--14744370
128
1.8
129
89
2
377
27
16
19
36
1.93
14747125--14747253
50
2.5
51
89
2
197
35
17
21
25
1.95
14747229--14747464
62
3.9
61
85
6
304
30
18
25
25
1.98
14747383--14747433
25
2.0
25
84
0
66
35
19
25
19
1.95
14747229--14747464
31
7.8
31
81
10
265
30
18
25
25
1.98
14747490--14747661
47
3.6
47
79
7
163
27
14
27
29
1.95
14747540--14747665
49
2.6
48
86
3
157
28
14
27
29
1.95
14747632--14747729
42
2.3
42
84
3
126
33
13
23
29
1.93
14752470--14752495
13
2.0
13
100
0
52
0
23
0
76
0.78
14754812--14754849
19
2.0
19
100
0
76
52
0
5
42
1.24
14755174--14755199
13
2.0
13
100
0
52
76
0
23
0
0.78
14760110--14760238
50
2.5
51
89
2
197
34
16
22
26
1.95
14760112--14760255
50
3.0
46
83
8
114
35
15
22
26
1.94
14760214--14760517
31
9.8
31
88
5
463
27
19
26
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14760546--14760755
47
4.5
48
81
10
199
28
14
27
29
1.95
14760685--14760801
42
2.8
42
84
5
155
32
13
25
28
1.94
14763088--14763215
46
2.8
46
90
0
193
21
21
28
29
1.98
14764712--14764752
5
8.0
5
83
5
55
41
0
2
56
1.13
14766068--14766106
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
14766345--14766479
39
3.4
39
75
6
121
22
20
28
28
1.98
14778258--14778609
87
4.1
87
81
10
366
32
21
23
22
1.98
14778432--14778594
81
2.0
81
86
4
231
30
20
25
23
1.99
14778612--14778727
45
2.6
45
80
4
137
32
21
21
24
1.98
14778712--14778741
14
2.1
14
93
0
51
26
13
40
20
1.89
14779363--14779395
16
2.0
17
88
5
50
0
15
9
75
1.03
14780349--14780390
20
2.2
19
83
12
50
28
7
7
57
1.52
14780524--14780562
19
2.0
20
85
5
53
38
2
7
51
1.44
14780583--14780612
15
2.1
14
93
6
51
33
6
0
60
1.23
14781134--14781381
128
1.9
129
90
2
392
28
17
17
36
1.93
14781922--14781978
21
2.9
19
75
12
62
47
0
3
49
1.18
14783660--14784024
46
8.0
46
85
1
410
41
13
22
22
1.88
14783661--14784054
137
2.9
137
83
3
364
41
13
22
22
1.88
14786328--14786366
17
2.3
17
86
8
53
30
0
20
48
1.50
14797122--14797348
46
4.9
46
91
1
321
21
24
13
40
1.89
14799401--14799448
11
4.2
11
79
10
60
64
0
0
35
0.94
14799395--14799450
24
2.3
24
87
3
76
60
1
0
37
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14816916--14816944
11
2.7
11
94
5
51
24
0
0
75
0.80
14817231--14817275
17
2.6
17
96
0
81
20
6
22
51
1.70
14822213--14822251
21
1.9
20
84
5
51
46
2
5
46
1.38
14827220--14827253
5
6.8
5
100
0
68
0
41
0
58
0.98
14827220--14827261
15
2.8
15
92
0
57
0
38
2
59
1.10
14832315--14832434
60
2.0
60
100
0
240
26
18
16
38
1.92
14837288--14837326
15
2.5
16
83
4
53
35
20
10
33
1.86
14837269--14837314
15
3.1
15
78
12
51
34
30
8
26
1.86
14838771--14838832
30
2.1
30
91
8
101
27
3
9
59
1.44
14842774--14842812
15
2.5
16
80
20
55
35
0
0
64
0.94
14842789--14842860
30
2.5
30
84
11
96
44
0
0
55
0.99
14849848--14850051
102
2.0
102
98
0
390
39
20
12
27
1.88
14853459--14853527
22
3.1
22
95
0
120
27
15
21
34
1.94
14859913--14860046
44
3.0
44
87
2
189
35
20
14
29
1.92
14870291--14870354
32
2.0
32
84
6
85
7
6
21
64
1.43
14874306--14874512
47
4.3
47
78
9
161
25
15
28
29
1.96
14874360--14874512
47
3.2
47
82
2
173
23
16
29
30
1.96
14878248--14878357
47
2.3
47
80
6
125
36
20
15
27
1.93
14884270--14884307
15
2.5
15
86
4
58
78
0
21
0
0.74
14884272--14884311
19
2.2
18
86
13
55
75
0
25
0
0.81
14885693--14885735
21
2.0
21
100
0
86
32
23
4
39
1.75
14893549--14893575
13
2.1
13
100
0
54
14
33
14
37
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14907184--14907243
26
2.3
25
83
11
68
55
1
0
43
1.10
14911230--14911256
13
2.1
13
100
0
54
55
14
7
22
1.64
14915625--14915681
30
1.9
30
82
13
73
43
3
0
52
1.18
14921910--14922016
26
4.2
26
91
1
180
33
7
23
35
1.83
14923638--14923777
54
2.6
54
91
2
228
17
24
23
35
1.95
14923638--14923777
27
5.2
27
83
6
178
17
24
23
35
1.95
14923638--14923794
27
5.8
27
79
11
162
18
24
21
35
1.96
14930372--14930397
7
3.7
7
100
0
52
26
42
0
30
1.56
14937624--14937663
21
2.0
21
85
5
55
67
7
2
22
1.28
14937942--14937995
22
2.4
23
79
11
60
50
0
1
48
1.11
14968329--14968463
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
14970712--14970752
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
14970789--14970851
30
2.1
30
91
5
101
28
4
7
58
1.47
14983575--14983633
29
2.0
31
83
6
77
33
0
8
57
1.29
14983727--14983775
21
2.3
21
92
0
80
48
0
6
44
1.27
14983987--14984031
19
2.4
18
82
13
56
64
0
35
0
0.94
14986176--14986308
22
5.8
22
86
6
133
18
24
18
37
1.94
14986219--14986280
25
2.5
25
97
0
115
17
25
20
35
1.95
14986167--14986319
22
6.6
22
81
12
116
18
25
18
37
1.94
14988922--14988980
29
2.0
31
83
6
77
33
1
8
55
1.40
14989082--14989121
20
2.0
20
95
0
71
50
0
2
47
1.14
14989332--14989376
19
2.4
18
82
13
56
64
0
35
0
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14992561--14992680
48
2.5
48
80
5
129
36
14
21
27
1.92
14994410--14994471
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
14996055--14996100
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
14996062--14996106
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
15005164--15005261
12
8.2
12
71
8
56
9
8
50
32
1.64
15005146--15005216
36
2.0
36
94
0
124
5
12
49
32
1.64
15005136--15005309
24
7.2
24
77
6
93
7
8
50
33
1.61
15005148--15005276
60
2.2
60
88
0
186
8
10
48
33
1.67
15005208--15005285
36
2.2
36
83
0
93
8
6
50
34
1.60
15005244--15005342
48
2.1
48
88
0
144
10
11
47
31
1.72
15005148--15005309
60
2.7
60
83
3
166
8
9
50
32
1.64
15005244--15005342
24
4.1
24
84
0
117
10
11
47
31
1.72
15005371--15005424
12
4.4
12
81
11
56
12
0
64
22
1.27
15013117--15013157
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
15017694--15017727
9
3.8
9
96
0
59
76
0
23
0
0.79
15018120--15018186
29
2.2
31
86
5
93
56
4
2
35
1.35
15018634--15018669
18
2.0
18
100
0
72
38
11
16
33
1.84
15018773--15018811
20
1.9
20
84
5
51
38
2
5
53
1.37
15019807--15019936
65
2.0
65
93
1
226
34
6
9
50
1.59
15028253--15028285
17
1.9
17
88
11
50
21
6
0
72
1.05
15028414--15028471
31
1.9
31
82
6
75
51
6
0
41
1.28
15030905--15030983
28
2.8
28
86
0
104
34
11
25
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15031741--15031819
28
2.8
28
84
0
95
35
11
24
29
1.90
15048488--15048526
19
2.1
19
95
0
69
51
10
5
33
1.58
15049378--15049427
15
3.4
15
86
2
75
36
0
12
52
1.39
15049792--15049849
23
2.5
23
100
0
116
6
3
43
46
1.47
15049954--15049994
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
15049942--15049981
13
3.2
13
80
19
50
50
0
25
25
1.50
15057510--15057556
4
11.8
4
84
8
60
2
27
0
70
0.99
15063614--15063651
9
3.7
10
86
13
51
23
0
2
73
0.95
15067888--15068388
167
3.0
167
100
0
1002
26
20
17
35
1.94
15084824--15085155
176
1.9
175
86
5
472
15
34
17
32
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325