Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  236  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74458620--74458786
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43
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1.90
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7.4
30
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153
21
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74460669--74460826
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24
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27
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2.2
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1.32
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2.0
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0
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0
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2.0
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0
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22
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2.3
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0
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1.9
57
94
0
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21
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
2
32
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74531547--74531601
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2.5
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0
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0
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74531546--74531618
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3.4
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79
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21
0
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1.53
74533018--74533072
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2.2
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1.40
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9
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2
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74534977--74535111
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0
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1.57
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1.96
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198
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19
27
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1.97
74541309--74541426
42
2.8
41
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128
21
18
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33
1.96
74541266--74541426
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1.9
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209
21
19
27
31
1.97
74541092--74541446
87
4.1
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234
21
21
26
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1.98
74541225--74541469
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5
203
22
20
25
31
1.98
74542372--74542410
18
2.2
18
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0
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2
2
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2.9
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58
5
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1.45
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2.4
16
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43
28
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1.75
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4.3
30
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8
202
19
6
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1.71
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56
2.0
56
96
0
208
21
7
47
23
1.75
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13
5.5
13
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20
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1.76
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3.0
26
87
3
106
39
18
5
36
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.25
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0
1
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0
1
19
0.78
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5
18.4
5
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10
111
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0
1
19
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0
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20
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2.8
12
100
0
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66
0
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0
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11
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1.97
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34
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15
1.9
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100
0
58
24
6
20
48
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74602568--74602681
30
3.4
30
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30
5
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1.32
74602560--74602722
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45
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8
134
47
12
1
38
1.52
74609260--74609326
31
2.2
31
83
0
80
17
4
17
59
1.53
74609401--74609569
43
4.0
42
95
2
293
20
35
18
24
1.95
74609401--74609569
85
2.0
85
95
0
302
20
35
18
24
1.95
74609967--74610011
16
2.6
18
80
20
60
22
6
4
66
1.33
74609967--74610011
17
2.6
17
82
10
65
22
6
4
66
1.33
74610557--74610848
132
2.2
133
92
1
489
31
18
17
32
1.95
74610822--74610965
71
2.0
71
97
0
270
29
15
21
34
1.94
74611877--74611932
19
2.9
19
84
7
69
32
17
7
42
1.77
74618539--74618563
9
2.8
9
100
0
50
32
0
0
68
0.90
74622631--74622703
29
2.4
29
88
4
101
47
8
6
36
1.60
74625372--74625489
22
5.4
21
83
5
110
44
16
21
17
1.86
74626137--74626199
26
2.2
27
83
13
74
52
9
7
30
1.62
74626134--74626207
29
2.5
31
78
14
84
54
8
8
29
1.59
74628380--74628425
21
2.3
20
78
14
51
45
21
6
26
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74631334--74631377
21
2.1
21
100
0
88
27
4
18
50
1.66
74631954--74632134
46
3.9
46
77
7
168
27
17
18
35
1.94
74632449--74632492
2
22.0
2
100
0
88
0
0
50
50
1.00
74635008--74635091
41
2.0
41
100
0
168
41
14
22
21
1.89
74636328--74636389
21
3.0
21
87
0
97
11
33
27
27
1.91
74645361--74645392
5
6.6
5
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7
57
18
0
0
81
0.70
74645361--74645391
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
74650766--74650850
43
2.0
43
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0
152
29
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16
20
1.94
74650764--74650865
43
2.4
43
88
0
141
34
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15
19
1.93
74654472--74654501
14
2.1
14
100
0
60
36
0
36
26
1.57
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2.1
33
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0
120
39
8
14
37
1.77
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14
4.4
14
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9
74
36
38
0
25
1.56
74655441--74655526
28
3.0
28
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1
82
45
30
0
24
1.54
74655424--74655499
21
3.6
20
73
19
66
38
34
1
26
1.65
74655461--74655607
7
20.7
7
73
10
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46
27
0
24
1.57
74655489--74655614
21
5.9
21
74
9
103
49
26
0
23
1.56
74655451--74655614
14
11.6
14
75
10
100
45
29
0
23
1.57
74656037--74656183
40
3.7
40
85
1
186
25
17
21
35
1.95
74661454--74661590
60
2.3
60
83
6
161
25
23
20
30
1.98
74661910--74661971
26
2.3
26
83
2
70
24
14
27
33
1.94
74665663--74665700
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
74672830--74672999
93
1.8
92
92
1
286
21
20
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74672834--74673004
46
3.7
46
79
11
197
22
20
28
29
1.98
74677754--74677782
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
74678350--74678483
54
2.5
54
95
0
232
28
20
21
29
1.98
74680172--74680312
39
3.6
39
91
0
210
31
2
19
46
1.64
74691346--74691424
21
3.8
21
76
6
79
49
15
18
16
1.80
74691295--74691445
42
3.6
41
79
7
144
46
15
22
15
1.83
74703852--74703881
5
6.0
5
100
0
60
80
0
0
20
0.72
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2.5
31
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0
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44
11
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1.80
74714354--74714412
25
2.4
24
77
8
64
22
10
1
66
1.31
74722230--74722284
18
3.1
18
77
12
60
49
16
12
21
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325