Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  103  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33220749--33220791
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0
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2.2
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27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.8
176
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15
27
1.92
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1.93
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17
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6
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13
27
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.9
22
83
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36
26
22
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33381155--33381262
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4.2
26
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198
31
6
25
36
1.82
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5.2
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18
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22
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1.96
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0
0
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1.74
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21
3.4
21
82
3
74
41
10
17
30
1.84
33394886--33394915
14
2.1
15
93
6
53
13
3
0
83
0.77
33395665--33395727
27
2.4
26
79
10
74
36
3
0
60
1.13
33395682--33395727
12
3.6
12
78
16
56
34
0
0
65
0.93
33397363--33397403
21
2.0
21
85
0
55
73
4
2
19
1.13
33399071--33399109
20
2.0
20
84
0
51
71
5
0
23
1.05
33399156--33399198
20
2.2
20
82
0
50
60
0
2
37
1.10
33399190--33399313
19
6.6
19
68
19
57
64
1
3
30
1.19
33399289--33399314
12
2.2
12
100
0
52
76
0
0
23
0.78
33399145--33399208
8
7.5
8
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62
1
1
34
1.14
33399144--33399302
9
17.6
9
69
17
89
62
1
3
32
1.21
33399784--33399818
10
3.6
10
92
3
54
25
2
14
57
1.51
33408807--33408857
15
3.3
15
75
10
50
35
0
3
60
1.15
33409325--33409418
47
2.0
47
97
0
179
34
13
21
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33411581--33411619
17
2.4
16
87
8
53
30
0
7
61
1.24
33417980--33418010
13
2.4
13
94
0
53
45
9
9
35
1.70
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2
15.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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36
2.0
36
91
0
117
36
18
2
43
1.64
33422210--33422268
31
1.9
31
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6
84
33
11
8
45
1.71
33428731--33428777
16
2.9
17
78
12
55
61
0
2
36
1.08
33428758--33428819
22
2.8
21
72
20
54
54
1
3
40
1.26
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3
17.3
3
100
0
104
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0
0
67
0.91
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5.0
5
100
0
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0
20
0
0.72
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6.0
24
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5
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27
23
20
27
1.99
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48
2.4
46
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4
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29
24
20
26
1.99
33440212--33440268
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
33440205--33440270
20
3.3
20
95
0
123
31
19
12
36
1.89
33440205--33440259
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
33441516--33441590
27
2.8
27
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11
82
21
20
22
36
1.96
33441608--33441887
27
10.3
27
77
1
146
33
8
19
38
1.83
33441721--33441860
54
2.6
54
82
4
183
30
7
21
40
1.80
33441608--33441845
81
2.9
82
76
6
223
31
8
19
40
1.82
33441839--33442041
54
3.8
54
87
0
262
40
7
22
29
1.82
33441839--33442041
27
7.5
27
86
2
237
40
7
22
29
1.82
33442055--33442144
27
3.3
27
84
6
112
33
10
16
40
1.82
33445107--33445161
23
2.3
24
93
6
94
41
21
9
27
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33448877--33448933
18
3.0
19
84
5
71
56
1
0
42
1.10
33448871--33448932
19
3.3
19
82
6
74
58
3
0
38
1.15
33448902--33448945
18
2.5
17
82
10
52
50
6
0
43
1.29
33449113--33449145
16
2.0
17
88
5
50
33
3
12
51
1.54
33452369--33452415
25
2.0
24
87
8
69
65
2
19
12
1.35
33452582--33452621
18
2.3
17
83
8
53
25
7
32
35
1.84
33460695--33460767
33
2.2
32
79
18
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47
2
6
42
1.44
33462549--33462961
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27
22
20
30
1.98
33462537--33462698
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1.9
87
84
2
218
25
24
20
29
1.99
33462516--33462965
214
2.1
214
89
3
670
27
22
20
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          321   322   323   324   325