Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  44  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16105829--16105932
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2.3
44
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3
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16107775--16107818
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2.1
21
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0
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3
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16109207--16109708
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4.0
126
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3
609
28
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15
40
1.88
16109211--16109708
252
2.0
251
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3
698
27
15
15
40
1.88
16114690--16115115
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2.0
211
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0
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11
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16129668--16129704
19
2.0
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1.40
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0
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52
0
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0
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32
0
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16155719--16155758
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1.9
21
100
0
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32
0
10
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1.49
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28
1.93
16159968--16160334
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3.7
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9
501
34
14
22
28
1.93
16159982--16160334
196
1.8
196
92
0
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4.0
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4
467
34
14
21
28
1.93
16159968--16160339
144
2.6
143
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382
34
14
22
28
1.93
16163062--16163451
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3.1
125
81
4
403
30
16
15
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16163551--16163593
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0
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1
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100
0
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0
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2.0
21
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21
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18
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12
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16191279--16191432
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2.9
54
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1
202
36
13
12
37
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16191583--16191674
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2.1
44
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16193247--16193280
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2.0
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2
0
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16193246--16193280
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5
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2
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17
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3
0
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1.11
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100
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57
21
4
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73
1.02
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2.7
13
95
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100
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0
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0
1
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0
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51
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0
0
68
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.4
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45
4
4
46
1.41
16249985--16250033
15
3.1
15
91
8
71
36
6
26
30
1.81
16249986--16250036
18
3.0
18
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968
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17
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1.94
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15
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51
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6
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50
1.45
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2.0
56
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149
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50
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50
50
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17
1.79
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235
2.0
234
98
0
911
29
15
13
41
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16326899--16326961
31
2.0
31
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0
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12
1
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1.50
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19
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16344671--16344861
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12
23
32
1.91
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1.8
104
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5
289
31
11
23
32
1.91
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24
2.5
24
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0
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0
28
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1.57
16349660--16349704
23
2.0
23
82
8
56
37
6
15
40
1.74
16353114--16353224
10
12.2
9
69
17
52
65
1
0
31
1.09
16361966--16362016
21
2.3
22
83
12
61
54
7
1
35
1.40
16364802--16364836
15
2.3
15
85
0
52
62
5
31
0
1.18
16376608--16376648
18
2.2
19
87
12
59
65
9
4
19
1.40
16379682--16379732
13
3.9
13
76
0
57
35
23
7
33
1.84
16385097--16385156
29
2.1
29
100
0
120
38
13
15
33
1.86
16562503--16562543
13
3.3
13
73
13
50
63
17
4
14
1.47
16562496--16562543
24
2.0
24
100
0
96
62
16
4
16
1.48
16562679--16562715
9
4.1
9
89
0
56
48
13
8
29
1.71
16562758--16562817
29
2.0
30
90
3
95
20
35
0
45
1.51
16562767--16562824
29
2.0
29
89
3
89
20
37
0
41
1.53
16563942--16563989
24
2.0
24
100
0
96
54
16
8
20
1.68
16569469--16569511
21
1.9
22
86
13
61
46
0
2
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16586212--16586249
18
2.1
18
85
9
51
36
0
2
60
1.11
16590936--16590979
6
7.2
6
92
2
70
0
61
0
38
0.96
16592181--16592217
17
2.1
18
90
5
58
29
10
35
24
1.89
16594444--16594486
19
2.3
19
92
4
70
55
11
2
30
1.48
16594442--16594479
19
2.0
19
100
0
76
52
10
5
31
1.58
16599328--16599365
3
12.7
3
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0
67
65
2
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0
1.06
16602314--16602558
125
1.9
126
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1
429
31
19
20
28
1.96
16605968--16606044
29
2.7
29
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15
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25
6
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54
1.62
16607845--16607877
17
2.1
16
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11
50
30
0
0
69
0.88
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21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
16607953--16608002
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
16613362--16613390
5
5.8
5
100
0
58
41
0
0
58
0.98
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17
2.0
17
88
0
50
23
0
5
70
1.09
16619543--16619576
18
1.9
18
88
5
52
41
11
0
47
1.40
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17
2.1
19
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9
62
55
2
5
36
1.37
16629255--16629294
19
2.1
19
100
0
80
7
57
15
20
1.61
16650136--16650328
52
3.8
52
77
6
175
29
29
17
24
1.97
16652952--16652991
17
2.2
18
86
8
55
62
0
0
37
0.95
16661169--16661374
105
2.0
105
91
0
331
44
4
5
46
1.46
16662422--16662509
43
2.0
43
97
0
167
46
15
10
27
1.78
16663226--16663262
20
1.9
18
89
10
56
43
0
21
35
1.53
16674074--16674137
25
2.6
25
95
5
112
32
12
34
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16675228--16675325
7
14.0
7
72
8
65
38
41
0
19
1.51
16675352--16675445
46
2.0
46
93
0
161
44
25
2
27
1.65
16675363--16675460
7
13.4
7
72
12
63
48
24
1
25
1.57
16675617--16675777
41
3.9
41
93
0
268
18
24
23
32
1.97
16675635--16675856
41
5.4
40
83
7
112
20
22
22
34
1.97
16675890--16675915
12
2.2
12
100
0
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30
15
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17
2.1
17
88
0
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2
1.28
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15
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0
1
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1.10
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19
72
27
50
50
0
2
48
1.12
16680358--16680389
13
2.5
13
100
0
64
78
0
6
15
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325