Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  27  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
102
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47
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
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1.91
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1.9
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93
96
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29
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21
1.98
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219
28
28
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21
1.98
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30
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2.8
16
81
15
56
31
11
0
57
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10269724--10269763
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2.0
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0
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18
2.1
18
89
5
56
41
0
25
33
1.55
10312816--10312918
37
2.7
38
72
6
91
23
19
26
31
1.98
10314100--10314146
22
2.2
22
88
7
71
34
4
4
57
1.38
10317749--10317786
20
1.9
20
94
0
67
31
5
0
63
1.17
10319197--10319246
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
10323825--10323874
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
10336788--10336862
28
2.7
27
83
6
89
49
0
1
49
1.09
10336798--10336896
33
3.0
31
79
15
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49
0
2
48
1.12
10341196--10341236
21
2.0
21
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0
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19
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29
1.98
10353178--10353234
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68
5
0
26
1.11
10353189--10353236
26
2.0
24
88
12
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6
0
29
1.18
10354245--10354364
42
2.9
42
85
5
127
40
18
25
16
1.91
10354277--10354364
21
4.2
21
72
5
70
38
18
26
17
1.92
10355931--10355972
15
2.8
15
78
10
50
61
2
0
35
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10359316--10359361
16
2.8
17
78
12
51
23
13
0
63
1.30
10360696--10360885
106
1.8
105
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3
301
43
6
13
36
1.69
10363159--10363209
15
3.5
15
71
15
52
64
1
0
33
1.05
10365329--10365373
19
2.3
19
84
7
54
48
6
0
44
1.29
10365530--10365594
25
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24
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49
1
3
46
1.27
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1.9
32
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0
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1.32
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6
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0
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0
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0
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0
0
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0.92
10387417--10387455
16
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18
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66
0
2
30
1.05
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15
100
0
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62
6
0
31
1.20
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4.3
9
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11
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4
0
48
1.23
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2.0
33
100
0
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1.86
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51
5.2
51
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1
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14
32
1.94
10408458--10408721
101
2.6
101
95
0
465
29
22
14
32
1.94
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101
2.6
101
96
0
483
29
23
15
32
1.95
10424926--10425186
51
5.2
51
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1
400
29
22
15
32
1.95
10427240--10427285
20
2.3
20
78
14
51
63
0
2
34
1.07
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25
2.7
21
80
14
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25
0
5
70
1.08
10441857--10441916
24
2.7
21
78
14
57
25
0
5
70
1.08
10441857--10441917
23
2.6
25
73
19
60
26
0
4
68
1.09
10442295--10442321
5
5.4
5
100
0
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22
0
0
77
0.76
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17
2.3
18
86
4
55
37
2
0
60
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10442922--10442963
16
2.4
17
84
11
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59
2
2
35
1.23
10446946--10447083
40
3.5
40
95
1
242
32
17
1
48
1.56
10448198--10448222
13
1.9
13
100
0
50
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12.0
44
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477
26
25
17
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1.97
10448278--10448730
133
3.4
132
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1
730
26
24
18
30
1.98
10448322--10448793
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5.4
87
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11
295
25
24
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1.98
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205
4.8
205
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1
1572
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1.97
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5
5
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3.9
40
95
0
258
29
20
3
46
1.66
10462182--10462335
79
1.9
79
92
2
256
29
20
3
46
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325