Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  187  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59118467--59118516
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2.1
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1
1
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.3
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65
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42
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.95
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3.9
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111
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16
30
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59307705--59307734
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2.1
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2.1
16
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1.99
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1.99
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233
29
28
15
26
1.96
59328126--59328308
79
2.3
81
83
7
223
24
22
27
24
2.00
59328127--59328310
40
4.6
40
82
9
207
24
22
28
24
2.00
59328179--59328343
79
2.1
79
83
6
201
26
21
27
24
1.99
59331017--59331051
16
2.2
16
100
0
70
25
5
11
57
1.56
59334692--59334726
17
2.1
17
100
0
70
28
17
11
42
1.83
59335963--59335995
13
2.4
14
90
5
50
30
15
3
51
1.58
59338191--59338216
13
2.0
13
100
0
52
53
15
7
23
1.67
59338779--59338815
16
2.3
16
85
0
56
27
18
29
24
1.98
59349610--59349812
99
2.1
99
98
0
388
27
11
22
38
1.89
59350187--59350257
15
4.7
15
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11
16
12
59
1.61
59350178--59350255
30
2.6
30
78
15
81
12
15
14
57
1.65
59350572--59350635
31
2.1
31
100
0
128
39
6
18
35
1.76
59353380--59353557
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
59353381--59353536
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59353377--59353557
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
59361569--59361746
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
59361570--59361725
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
59361566--59361746
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
59364260--59364432
46
3.7
46
72
13
165
22
17
27
32
1.96
59364251--59364424
93
1.9
93
95
0
312
22
18
27
31
1.97
59368427--59368468
21
2.0
21
85
0
57
21
16
42
19
1.89
59370124--59370230
46
2.3
46
100
0
214
26
28
24
20
1.99
59375456--59375500
23
2.0
22
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4
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64
6
8
20
1.44
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3.4
43
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5
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30
25
14
29
1.95
59390130--59390517
114
3.4
113
78
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368
31
20
21
26
1.98
59390130--59390537
111
3.6
109
76
5
332
30
20
21
26
1.98
59391229--59391394
66
2.5
66
80
8
169
48
30
0
21
1.50
59391362--59391409
22
2.2
22
85
7
62
58
22
0
18
1.39
59391422--59391461
20
2.1
19
86
13
55
47
32
0
20
1.50
59391488--59391548
28
2.1
28
87
3
86
60
14
0
24
1.34
59393557--59393582
10
2.6
10
100
0
52
7
11
0
80
0.89
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12
3.6
12
77
12
50
31
29
0
39
1.57
59394501--59394532
16
2.0
16
93
0
55
12
9
12
65
1.47
59394761--59394790
13
2.3
13
100
0
60
53
10
0
36
1.35
59399633--59399690
27
2.1
27
81
12
66
44
1
5
48
1.35
59400574--59400634
31
2.0
31
83
0
77
16
11
19
52
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59400710--59400889
43
4.2
43
83
0
198
30
30
14
25
1.95
59406699--59406849
27
5.6
27
86
4
196
27
13
28
31
1.94
59406699--59406849
82
1.9
81
87
4
223
27
13
28
31
1.94
59406699--59406849
55
2.8
53
87
4
203
27
13
28
31
1.94
59414589--59414739
27
5.6
27
86
4
196
27
13
28
31
1.94
59414589--59414739
82
1.9
81
87
4
223
27
13
28
31
1.94
59414589--59414739
55
2.8
53
87
4
203
27
13
28
31
1.94
59422106--59422614
47
10.7
47
94
1
840
32
8
29
29
1.87
59422733--59422876
37
3.9
37
90
0
218
25
18
29
26
1.98
59424293--59424555
40
6.6
40
88
3
363
22
22
28
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325