Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  7  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2234813--2234951
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86
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27
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
119
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2.00
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93
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21
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4.5
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135
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21
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19
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24
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12
20
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.43
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3.1
61
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2
1
57
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2427761--2428113
193
1.8
193
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1
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8
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1.63
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68
1.21
2445773--2445809
14
2.4
17
86
13
53
51
0
0
48
1.00
2447220--2447263
23
1.9
23
90
0
70
61
4
2
31
1.28
2447224--2447266
11
3.8
11
80
17
52
65
2
2
30
1.18
2454776--2454835
26
2.2
26
83
16
70
43
1
1
53
1.20
2462606--2462640
17
2.0
18
94
5
63
34
14
0
51
1.42
2466257--2466281
5
5.0
5
100
0
50
0
60
0
40
0.97
2466309--2466336
5
5.6
5
100
0
56
57
42
0
0
0.99
2471701--2471741
15
2.6
16
84
3
57
56
0
7
36
1.27
2476186--2476233
19
2.7
18
87
6
62
33
12
12
41
1.80
2476050--2476345
18
16.1
18
72
9
186
35
11
14
37
1.83
2477573--2477603
14
2.3
14
94
5
55
6
19
0
74
1.03
2478154--2478196
16
2.5
17
85
7
52
51
0
2
46
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2478160--2478217
21
2.9
20
82
12
75
55
0
0
44
0.99
2478208--2478241
17
1.9
17
88
5
50
79
2
8
8
1.03
2478218--2478290
33
2.2
33
78
7
78
69
4
21
4
1.22
2479393--2479507
61
1.9
61
92
3
196
40
16
1
40
1.59
2479646--2479773
18
7.1
18
76
7
98
35
15
13
35
1.87
2479888--2479993
45
2.3
47
86
4
144
39
21
21
16
1.92
2480739--2480778
20
2.0
20
100
0
80
50
0
5
45
1.23
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19
2.4
18
86
13
65
66
0
33
0
0.92
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19
2.1
19
85
0
51
35
7
7
48
1.61
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30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
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13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
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50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
2484871--2485120
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
2490262--2490300
19
2.1
19
85
0
51
35
7
7
48
1.61
2491532--2491563
13
2.5
13
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0
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31
0
12
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1.37
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49
4.7
49
80
9
223
27
23
28
20
1.99
2491664--2491904
98
2.3
103
82
10
289
26
23
28
21
1.99
2664173--2664215
22
2.0
22
85
0
59
60
11
9
18
1.57
2665406--2665557
37
3.9
37
81
13
173
26
21
15
35
1.94
2665474--2666064
46
12.6
46
84
10
668
29
22
14
34
1.93
2665563--2665676
52
2.2
52
89
7
169
29
22
11
35
1.89
2665474--2666064
98
6.3
96
81
13
685
29
22
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2665664--2665781
37
3.0
37
83
13
164
27
22
14
36
1.92
2665741--2666058
52
6.3
52
86
7
426
28
22
13
34
1.93
2669121--2669266
49
3.0
49
91
1
238
31
29
15
23
1.95
2670511--2670656
37
4.0
37
93
1
242
24
21
16
36
1.94
2670620--2670885
45
5.6
45
90
6
343
28
22
14
34
1.93
2670663--2670879
52
4.3
51
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8
304
28
22
14
35
1.93
2679437--2679474
13
2.9
13
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11
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39
2
2
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1.28
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2.5
22
81
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65
60
0
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35
1.15
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20
2.8
20
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62
0
3
34
1.12
2681100--2681164
29
2.3
28
84
7
78
47
1
1
49
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325