Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  168  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
53133288--53133331
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Period
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Score
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22
27
2.00
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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Period
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2.0
26
88
8
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16
6
4
73
1.19
53305525--53305549
13
1.9
13
100
0
50
0
16
0
84
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13
2.8
13
95
0
65
18
5
2
72
1.15
53307101--53307263
82
2.0
82
85
2
220
25
25
14
34
1.93
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5.1
11
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18
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5
17
1.23
53308067--53308091
13
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13
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0
50
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0
16
0
0.63
53308074--53308133
25
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1
11
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53309023--53309081
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21
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2.0
82
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2
220
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24
25
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53312097--53312148
23
2.3
22
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21
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23
1
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53316302--53316347
18
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13
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58
6
0
34
1.24
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10
3.7
10
88
0
56
37
18
29
13
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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30
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27
27
16
27
1.97
53320596--53320660
20
3.3
19
73
16
51
38
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21
23
1.93
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33
1.9
33
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12
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2.0
22
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0
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12
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2.2
22
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12
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18
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15
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1.23
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6
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7
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71
1.23
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2.3
20
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47
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1
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20
2.3
20
85
0
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29
36
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21
1.91
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2.1
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0
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2.3
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30
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1.35
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3.1
18
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51
7
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1.27
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12
2.1
12
100
0
50
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0
76
1.02
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16
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17
57
1
16
1
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0.89
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6
8.2
6
83
16
59
0
18
2
80
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53334887--53334947
21
2.8
21
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5
86
1
16
1
80
0.88
53334889--53334947
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1.9
30
83
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1
16
1
79
0.89
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19
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0
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0
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4.2
27
80
3
111
16
23
23
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325