Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  37  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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15
2.8
16
81
15
56
40
4
0
55
1.20
14008246--14008313
9
7.9
9
71
12
54
38
2
0
58
1.13
14008254--14008313
18
3.4
18
77
11
61
36
3
0
60
1.14
14008367--14008488
12
10.6
11
66
18
54
34
1
4
59
1.29
14008366--14008463
26
4.0
24
78
19
87
37
0
5
57
1.21
14008638--14008719
38
2.2
38
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10
105
32
2
2
62
1.22
14008611--14008684
14
5.0
15
71
19
50
29
2
1
66
1.14
14008639--14008720
39
2.1
39
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4
121
34
2
2
60
1.23
14008617--14008731
32
3.3
34
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19
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32
4
1
61
1.25
14008715--14008775
21
2.8
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16
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34
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50
1.57
14008715--14008767
21
2.4
23
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14
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33
5
9
50
1.58
14014962--14015020
21
2.9
19
81
16
66
42
1
0
55
1.09
14014962--14015018
20
2.8
21
85
15
68
43
1
0
54
1.10
14015324--14015367
17
2.5
17
77
3
52
34
4
2
59
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14016661--14016697
18
2.1
18
89
0
56
27
0
8
64
1.21
14026639--14026663
12
2.1
12
100
0
50
44
16
8
32
1.76
14027692--14027733
21
2.0
21
85
0
57
69
2
2
26
1.13
14033398--14033661
45
5.9
45
93
0
420
25
20
15
38
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2.0
16
100
0
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12
12
1.75
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0
420
25
19
15
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1.91
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2.0
20
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0
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20
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1.89
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25
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2.0
25
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0
84
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17
5
39
1.74
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2.8
22
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2
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68
6
6
18
1.33
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2.0
16
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0
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6
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21
1.71
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3
100
0
72
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0
0
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0.92
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3
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3
92
7
51
63
0
0
36
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2.2
123
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1
524
59
6
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30
1.40
14063962--14064018
21
2.6
21
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78
36
26
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33
1.74
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7
6.6
7
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11
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71
0
2
26
0.97
14065206--14065286
29
2.8
29
71
19
69
65
1
2
30
1.13
14077409--14077603
93
2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41
14077636--14077669
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
14077636--14077674
17
2.4
16
87
8
53
43
5
0
51
1.24
14077640--14077679
17
2.3
18
83
12
57
47
5
0
47
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14077758--14077809
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
14077635--14077929
120
2.5
120
89
6
442
41
2
5
50
1.38
14077635--14077929
119
2.5
119
89
6
440
41
2
5
50
1.38
14077886--14077927
15
2.7
16
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14
52
45
0
2
52
1.13
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15
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46
0
0
53
1.00
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75
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187
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2
3
47
1.36
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2.0
155
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540
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3
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0
0
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0
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0
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14
2.0
14
100
0
56
57
0
7
35
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325