Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  88  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29574821--29574858
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1.9
20
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0
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1.69
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29591781--29591862
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29591770--29591868
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33
1.39
29593210--29593653
46
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46
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20
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228
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19
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126
11
18
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2.0
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0
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2.1
18
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100
0
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0
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2.1
15
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0
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38
0
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54
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
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20
6
1
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3.2
30
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0
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1.95
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1.95
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1.96
29656644--29657398
154
4.9
152
74
11
619
32
23
16
27
1.96
29656644--29657402
73
9.9
73
75
12
571
32
22
16
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1.96
29656039--29657503
545
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16
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1.95
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3.2
232
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22
16
27
1.96
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2.0
70
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0
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33
1.96
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232
5.2
233
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10
1025
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16
21
33
1.95
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14.5
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76
10
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1.96
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312
3.4
309
78
10
897
29
17
21
32
1.95
29669499--29670618
154
7.2
156
74
11
719
28
17
21
32
1.96
29670200--29670623
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5
444
31
18
19
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1.95
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1.94
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20
2.0
20
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1
1
49
1.23
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3.6
11
96
3
73
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
0
47
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11
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51
50
0
0
50
1.00
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2.0
43
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1.83
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2.1
16
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5
20
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1.71
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16
100
0
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12
12
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381
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10
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1.88
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2.2
136
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2.0
20
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11
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1.72
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14
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0
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1
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13
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0
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35
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0
0
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1.9
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71
0
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15
1.14
29723846--29724168
153
2.1
151
94
1
567
56
6
8
28
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29724101--29724160
30
2.2
27
82
14
70
65
5
5
25
1.34
29731525--29731573
25
2.0
25
83
0
62
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0
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1.48
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2.0
23
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1.65
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23
2.0
23
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40
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1.76
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15
100
0
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6
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1.66
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2.0
23
84
12
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45
10
6
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1.65
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2.0
23
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40
13
8
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1.76
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2.0
92
95
2
336
35
14
15
35
1.87
29747628--29747659
11
2.8
12
90
9
50
81
0
18
0
0.70
29747627--29747659
17
1.9
17
88
11
50
78
0
21
0
0.75
29762970--29763015
21
2.2
21
81
11
51
30
4
4
60
1.35
29764278--29764329
20
2.6
20
84
6
61
40
23
1
34
1.66
29768981--29769105
41
3.1
39
76
2
97
27
20
12
40
1.87
29769291--29769351
7
8.7
7
100
0
122
27
13
0
59
1.35
29769994--29770024
6
5.2
6
92
0
53
48
0
51
0
1.00
29770218--29770255
19
2.0
20
94
5
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26
5
2
65
1.27
29770898--29770928
15
2.1
15
93
0
53
16
0
41
41
1.48
29770990--29771096
41
2.6
41
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2
144
22
23
17
36
1.95
29770990--29771142
41
3.8
41
81
5
116
23
21
17
37
1.94
29771130--29771155
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
29772633--29772666
15
2.1
16
89
10
52
50
2
0
47
1.16
29772692--29772735
23
1.9
23
90
9
72
59
18
4
18
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29774364--29774499
51
2.7
50
71
11
125
42
3
3
50
1.37
29774678--29774726
23
2.1
24
85
11
66
77
2
0
20
0.87
29775978--29776142
34
4.9
34
90
3
253
26
26
20
26
1.99
29778269--29778391
60
2.0
60
89
3
185
18
17
9
53
1.71
29778563--29778605
3
14.3
3
90
0
68
27
0
4
67
1.10
29781896--29781935
21
1.9
21
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0
53
45
5
35
15
1.68
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2.3
42
76
15
103
24
20
27
27
1.99
29787744--29787773
10
3.0
10
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0
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20
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0
66
1.24
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44
11.4
44
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2
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30
18
22
29
1.97
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14
2.9
14
82
10
55
82
2
0
15
0.77
29797195--29797237
14
3.1
14
77
12
52
81
4
0
13
0.84
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13
2.1
14
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6
51
51
0
3
44
1.18
29798711--29798774
31
2.0
32
85
8
87
45
0
7
46
1.32
29799697--29799740
15
2.9
15
82
0
61
36
2
13
47
1.56
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23
2.5
23
97
0
107
6
5
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44
1.53
29800271--29800311
19
2.2
19
87
12
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46
0
24
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1.53
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18
2.3
18
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8
55
43
12
5
38
1.65
29806180--29806210
15
2.1
15
93
0
53
25
32
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1.82
29809569--29809598
15
2.0
15
93
0
51
23
46
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23
1.75
29810338--29810376
18
2.3
18
86
8
55
43
12
5
38
1.65
29810534--29810564
15
2.1
15
93
0
53
25
32
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35
1.82
29811170--29811228
30
2.0
30
100
0
118
37
0
20
42
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29813785--29813826
22
1.9
22
85
9
59
26
0
4
69
1.08
29814027--29814102
25
2.9
25
79
14
75
23
2
7
65
1.32
29817905--29817960
10
5.7
9
80
16
58
23
5
1
69
1.18
29817905--29817964
20
3.0
19
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9
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21
6
1
70
1.20
29817907--29817966
30
2.0
31
84
15
81
21
6
1
70
1.20
29825766--29826094
130
2.5
129
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461
29
18
18
34
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2.7
54
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7
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30
26
14
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1.95
29828642--29828774
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2.5
53
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29
25
16
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1.97
29835661--29835811
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2.8
53
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4
196
29
27
17
25
1.97
29846863--29847552
264
2.6
264
87
3
960
31
20
24
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325