Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  318  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100255970--100256003
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11
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1
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1.19
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3.0
19
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1
1
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1.19
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2.0
21
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2
9
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.78
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2.0
22
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2.0
22
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2
42
1.54
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2.3
94
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3
258
35
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6
40
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.0
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2.0
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11
22
1.90
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3
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2.0
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100431683--100431801
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3
69
21
68
33
3
0
62
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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1
0
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1.06
100432202--100432265
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2.1
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1
0
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1
62
1.21
100446487--100446662
17
9.5
18
68
22
82
31
2
2
62
1.24
100446488--100446661
30
5.6
30
72
16
124
32
2
2
62
1.25
100446889--100446950
23
2.8
23
83
9
67
38
4
0
56
1.21
100446995--100447058
12
5.4
12
69
10
51
37
1
0
60
1.06
100464402--100464440
17
2.3
17
95
0
69
46
12
2
38
1.56
100467801--100467852
22
2.3
23
74
9
54
59
1
1
36
1.19
100467777--100467972
97
2.0
97
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0
302
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2
47
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100468273--100468304
13
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15
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10
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62
0
9
28
1.26
100468877--100468903
3
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3
100
0
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0
0
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26
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25
33
1.74
100471344--100471413
27
2.6
25
78
12
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0
4
38
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100471920--100471953
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0
0
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0
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20
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10
9.0
9
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1
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1.28
100475124--100475170
18
2.6
17
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18
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34
4
2
59
1.29
100475544--100475804
140
1.9
139
90
0
423
17
19
9
52
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100476758--100476822
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2.1
30
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8
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29
6
1
63
1.28
100483071--100483110
19
2.1
19
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0
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25
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32
1.89
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5
10.0
5
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0
1
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100494257--100494313
8
6.6
9
74
22
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0
1
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1.10
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42
0
1
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1.10
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18
2.1
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4
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41
0
10
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28
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0
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36
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37
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1.59
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21
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1
27
1.62
100507387--100507480
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2.0
46
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0
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2
28
1.67
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2.4
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5
117
19
21
16
42
1.89
100507650--100507766
40
2.9
41
82
5
132
20
22
17
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1.93
100509770--100509839
26
2.6
27
80
8
81
22
20
18
38
1.93
100517003--100517058
16
3.2
17
87
9
78
21
1
1
75
0.99
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19
2.0
19
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10
51
50
5
2
42
1.39
100517504--100517546
18
2.4
18
88
0
68
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0
2
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1.13
100518938--100519197
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85
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28
21
17
33
1.96
100520904--100520969
21
3.0
22
74
14
64
45
4
1
48
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100521388--100521470
21
4.4
19
74
15
66
42
3
0
54
1.18
100521378--100521470
39
2.4
37
78
8
98
43
3
0
53
1.16
100525399--100525601
47
4.3
47
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277
33
8
30
27
1.87
100525672--100525756
40
2.2
40
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2
118
17
20
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1.95
100547460--100547516
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1.74
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18
4
0
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0.94
100553708--100553751
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0
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1.93
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2.1
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80
0
0
20
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2.0
21
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14
57
52
0
2
45
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325