Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  9  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3044796--3044890
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1
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2.0
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45
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1.61
3045846--3045890
23
2.0
23
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0
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3.0
42
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19
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4.0
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2.0
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0
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0
0
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22
128
49
7
2
41
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3079952--3080139
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3.1
61
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2
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1.41
3079920--3080142
120
1.9
120
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2.0
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1.41
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2.0
22
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2
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0
0
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2.1
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46
2.9
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22
24
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4.2
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22
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28
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29
26
21
22
1.99
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16
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2
0
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16
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40
0
4
54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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72
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17
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19
2.1
19
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0
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0
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1
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1.03
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15
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11
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62
1
5
30
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3268906--3268974
13
5.0
13
80
13
66
13
0
50
36
1.41
3268895--3268959
30
2.2
30
94
0
112
12
0
53
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1.38
3268895--3268946
17
3.3
16
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17
56
11
0
55
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1.36
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21
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22
22
21
33
1.98
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2.7
175
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3
586
22
22
21
33
1.97
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44
5.4
43
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138
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20
21
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1.97
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17
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1.9
22
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4
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2
4
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83
0.87
3271617--3271656
18
2.3
18
86
4
55
2
12
2
82
0.87
3272222--3272260
9
4.2
9
83
6
51
41
12
12
33
1.82
3277258--3277295
20
1.9
20
84
10
51
55
2
15
26
1.54
3278703--3278731
11
2.5
12
94
5
51
86
0
13
0
0.58
3278722--3278802
40
2.0
40
97
0
153
44
12
25
17
1.84
3289548--3289611
28
2.3
28
94
0
110
28
9
3
59
1.44
3307280--3307387
46
2.4
46
85
1
146
18
14
15
50
1.77
3307350--3307579
46
5.0
46
86
0
298
23
19
13
43
1.87
3307316--3307576
138
1.9
138
85
1
362
22
18
13
45
1.84
3309666--3309700
11
3.2
11
91
0
61
71
0
2
25
1.00
3309668--3309743
20
3.8
20
76
13
59
61
3
1
32
1.22
3310348--3310418
35
2.0
35
100
0
142
30
25
9
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3311095--3311154
31
1.9
31
86
6
86
40
15
16
28
1.89
3313686--3313745
24
2.5
24
79
15
61
60
3
3
33
1.30
3316686--3316804
60
2.0
60
86
3
168
18
14
42
25
1.88
3320762--3320812
20
2.7
19
76
8
50
47
3
0
49
1.20
3321387--3321448
25
2.4
25
83
8
70
56
1
1
40
1.19
3321504--3321531
6
4.7
6
100
0
56
32
0
67
0
0.91
3321603--3321640
18
2.1
18
85
9
51
23
5
0
71
1.07
3341643--3341728
40
2.2
40
97
0
163
48
12
15
23
1.79
3353325--3353423
19
5.2
18
70
13
65
38
3
2
56
1.26
3353391--3353428
12
3.1
13
88
11
62
39
0
5
55
1.23
3354874--3355307
213
2.0
215
92
2
728
30
14
17
37
1.89
3358708--3358734
2
13.5
2
100
0
54
0
48
0
51
1.00
3369964--3370029
32
2.2
30
83
8
80
33
3
3
60
1.27
3370302--3370344
22
2.0
21
81
4
50
48
0
0
51
1.00
3370328--3370370
14
2.9
14
82
6
50
48
0
4
46
1.22
3376536--3376629
42
2.2
42
86
3
136
43
17
19
20
1.88
3381657--3381757
21
4.4
23
73
20
79
52
0
1
44
1.19
3392767--3392816
20
2.6
18
78
12
55
58
0
2
40
1.10
3392802--3392845
21
2.0
22
87
12
65
63
0
4
31
1.14
3392767--3392860
21
4.7
20
72
19
63
60
0
3
36
1.13
3392812--3392890
28
2.7
29
79
13
74
64
1
2
31
1.15
3402800--3402824
6
4.2
6
100
0
50
32
20
32
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3454073--3454103
16
2.0
16
93
6
55
74
0
25
0
0.82
3464330--3464367
18
2.1
18
95
0
67
50
7
0
42
1.31
3464434--3464464
5
6.2
5
92
0
53
41
0
0
58
0.98
3468211--3468329
59
2.0
58
83
6
150
42
21
16
18
1.89
3468271--3468612
41
8.4
41
87
2
438
34
22
21
20
1.96
3468271--3468612
81
4.2
80
85
5
420
34
22
21
20
1.96
3468271--3468612
163
2.1
163
88
3
501
34
22
21
20
1.96
3468271--3468612
122
2.8
120
85
6
447
34
22
21
20
1.96
3468816--3468851
16
2.2
16
100
0
72
47
0
22
30
1.52
3483070--3483121
26
2.0
26
96
0
95
34
11
21
32
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325