Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  15  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
A
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Entropy
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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10
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6
13
50
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.24
6091348--6091402
19
3.1
19
79
12
62
36
0
3
60
1.15
6095489--6095529
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
6100884--6100916
5
6.8
5
86
6
50
21
0
36
42
1.53
6107040--6107313
46
6.0
46
87
0
334
41
13
24
21
1.89
6107036--6107298
92
2.9
92
88
0
373
41
12
24
21
1.87
6107050--6107313
138
1.9
138
86
1
377
41
14
23
20
1.89
6109747--6109958
51
4.2
51
90
0
343
32
21
12
33
1.91
6109744--6109958
102
2.1
102
95
0
385
32
21
12
33
1.91
6112742--6112828
43
2.0
43
100
0
174
35
4
6
52
1.49
6115585--6115626
13
3.3
13
83
6
59
71
0
2
26
0.98
6117097--6117125
3
9.7
3
100
0
58
34
0
34
31
1.58
6118290--6118349
22
2.7
22
73
14
61
68
5
5
21
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6124883--6124923
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
6135001--6135042
15
2.6
17
81
7
52
11
7
7
73
1.23
6153341--6153366
11
2.4
11
100
0
52
7
0
0
92
0.39
6154898--6154923
11
2.4
11
100
0
52
50
0
0
50
1.00
6154888--6154949
28
2.2
28
82
5
72
51
6
1
40
1.37
6169423--6169470
22
2.2
23
81
11
64
64
4
4
27
1.30
6169434--6169481
22
2.2
22
84
0
60
64
10
4
20
1.41
6171791--6171925
39
3.4
39
76
8
123
23
20
27
28
1.99
6174896--6175028
60
2.2
59
79
7
144
34
6
12
46
1.67
6178333--6178372
21
1.9
21
89
0
62
57
2
2
37
1.26
6178425--6178463
20
2.1
19
90
9
62
58
7
2
30
1.39
6178700--6178738
18
2.0
20
85
9
55
53
7
5
33
1.51
6179262--6179286
6
4.2
6
100
0
50
0
52
48
0
1.00
6194546--6194755
52
4.2
50
76
8
189
30
31
16
21
1.95
6200067--6200120
25
2.2
25
82
0
63
42
1
18
37
1.61
6205528--6205559
7
4.6
7
96
0
55
75
0
0
25
0.81
6213875--6213925
23
2.2
23
82
10
59
37
21
9
31
1.86
6219930--6219981
26
2.0
26
100
0
104
30
15
34
19
1.93
6230576--6230627
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
6240483--6240517
18
1.9
18
88
0
52
42
5
8
42
1.59
6242587--6242636
21
2.5
19
72
27
50
48
2
0
50
1.12
6245054--6245191
47
3.0
47
93
3
237
38
18
23
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6245054--6245203
22
6.4
24
76
11
134
40
18
23
18
1.92
6247746--6247795
21
2.5
19
72
27
50
48
2
0
50
1.12
6250056--6250264
50
4.2
51
69
16
127
22
25
20
31
1.98
6250106--6250264
25
6.5
24
72
9
106
21
27
20
30
1.98
6258561--6258595
17
2.1
17
88
0
52
51
0
0
48
1.00
6274193--6274278
3
28.7
3
97
0
163
66
0
33
0
0.92
6280501--6280542
20
2.0
21
86
13
61
50
0
0
50
1.00
6292650--6292677
14
2.0
14
100
0
56
85
0
0
14
0.59
6295480--6295522
20
2.2
20
95
0
77
62
4
6
25
1.40
6295567--6295611
22
2.1
21
83
4
54
62
13
8
15
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325