Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  33  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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Period
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Copy
Number
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Score
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2.6
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3
59
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12661607--12661654
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67
26
3
3
67
1.21
12704053--12704246
61
3.2
61
68
16
177
43
2
6
47
1.39
12704114--12704160
16
3.0
16
78
12
53
46
0
2
51
1.13
12704020--12704277
120
2.1
120
94
0
453
43
2
5
48
1.39
12704234--12704275
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
12704225--12704266
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
12704450--12704513
16
4.0
16
91
0
101
34
35
0
29
1.58
12705433--12705464
14
2.3
14
100
0
64
6
15
46
31
1.71
12710544--12710575
14
2.3
14
100
0
64
6
15
46
31
1.71
12711297--12711383
39
2.3
39
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4
151
34
21
5
37
1.78
12711309--12711370
21
3.1
21
60
21
51
37
22
4
35
1.76
12720654--12720698
11
3.9
11
80
11
54
35
0
0
64
0.94
12720649--12720704
24
2.3
24
87
3
76
37
0
1
60
1.07
12722834--12723010
46
3.8
46
87
1
230
42
12
24
20
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12723098--12723154
13
4.3
13
72
2
51
36
3
24
35
1.73
12728522--12728596
37
2.0
37
100
0
150
33
16
16
34
1.90
12735307--12735367
30
2.0
30
81
6
70
42
4
0
52
1.23
12739010--12739043
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
12743649--12743682
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
12751335--12751366
16
2.0
16
100
0
64
31
31
25
12
1.92
12753408--12753464
28
2.0
28
83
13
71
63
0
0
36
0.95
12753408--12753480
30
2.4
31
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11
80
60
1
0
38
1.06
12753423--12753486
23
2.9
21
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9
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60
1
0
37
1.06
12754435--12754469
4
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4
93
0
61
74
2
0
22
0.95
12756920--12757026
3
35.3
3
81
5
117
60
1
6
30
1.32
12758478--12758617
44
3.2
45
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11
126
23
24
21
30
1.99
12758510--12758648
44
3.2
44
67
15
133
28
25
20
25
1.99
12758356--12758675
88
3.7
88
87
4
425
24
24
22
28
2.00
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6.6
46
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12
193
27
23
19
29
1.98
12758709--12759085
175
2.2
170
89
4
578
27
22
19
30
1.98
12758658--12759104
44
10.3
42
71
12
232
25
23
20
30
1.98
12760520--12760546
1
27.0
1
100
0
54
0
0
0
100
0.00
12761392--12761421
8
3.6
8
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4
51
13
0
13
73
1.10
12766313--12766413
3
33.3
3
80
5
105
60
1
6
30
1.34
12779667--12779707
21
2.0
21
100
0
82
41
9
4
43
1.59
12780470--12780516
18
2.6
19
76
6
53
48
4
2
44
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12793345--12793388
22
2.1
21
84
16
56
22
29
20
27
1.99
12804068--12804105
19
2.1
19
90
9
62
57
5
0
36
1.21
12807215--12807265
2
25.5
2
86
7
68
43
3
0
52
1.19
12807208--12807260
25
2.1
25
100
0
106
39
7
0
52
1.30
12808284--12808335
25
2.0
28
88
11
83
51
3
1
42
1.31
12808345--12808409
20
3.3
19
74
20
62
55
6
6
32
1.49
12808880--12808937
20
2.9
19
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7
71
32
3
1
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1.22
12809068--12809110
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12
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2
0
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1.03
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0
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25
2
2
70
1.09
12817589--12817661
30
2.4
29
79
16
78
54
1
6
36
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325