Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  87  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Score
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1.93
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16
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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26
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29445491--29445553
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1.71
29466006--29466086
40
2.0
40
100
0
162
53
17
14
14
1.74
29469000--29469059
31
1.9
31
83
10
77
33
1
0
65
1.03
29471390--29471437
16
3.0
16
90
0
69
0
47
0
52
1.00
29472056--29472123
21
2.9
25
75
20
67
30
1
2
64
1.17
29472036--29472108
21
3.5
21
76
16
73
31
1
4
63
1.22
29472079--29472138
24
2.4
24
80
5
66
31
5
1
61
1.27
29472188--29472244
23
2.5
24
83
13
75
29
8
5
56
1.52
29472399--29472460
28
2.2
28
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5
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38
6
3
51
1.44
29484750--29485046
74
4.1
72
74
14
252
26
18
23
31
1.97
29484955--29485213
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2
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25
17
21
34
1.96
29485064--29485386
161
2.0
160
95
0
574
26
17
21
33
1.96
29485132--29485288
74
2.1
73
91
4
262
26
16
23
33
1.96
29485205--29485432
87
2.6
87
90
3
334
27
16
20
35
1.93
29484905--29485432
250
2.1
249
91
0
842
26
17
22
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29487386--29487434
25
2.0
25
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0
71
32
2
0
65
1.04
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23
2.5
24
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13
75
29
8
5
56
1.52
29487712--29487773
28
2.1
30
85
11
85
40
6
3
50
1.44
29495476--29495514
20
1.9
21
84
5
53
38
10
2
48
1.51
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24
2.3
24
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0
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1.74
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2.4
34
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28
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16
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1.88
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2.0
31
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0
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25
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1
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0
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2.0
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0
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17
1.9
17
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27
3
3
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2.7
19
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40
0
0
59
0.98
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3.1
8
100
0
50
16
0
0
84
0.63
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26
2.7
26
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2
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22
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22
1.97
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1.9
32
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22
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1.92
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24
4.0
24
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4
140
27
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21
29
1.99
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9
5.4
9
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16
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37
20
7
33
1.81
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20
3.3
20
89
0
107
34
20
10
34
1.87
29533464--29533519
11
5.5
11
75
16
57
33
19
10
35
1.87
29533567--29533614
25
1.9
25
82
0
60
25
14
25
35
1.94
29537475--29537513
20
2.0
20
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10
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30
2
0
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23
2.6
25
76
10
65
54
4
1
39
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29537935--29537976
19
2.2
19
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8
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69
2
2
26
1.13
29542713--29542837
46
2.7
46
96
2
225
22
16
24
36
1.95
29545205--29545278
25
3.0
25
75
0
76
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27
1.91
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44
82
0
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20
32
23
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15
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2
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36
0
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2.0
20
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0
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5
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0
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25
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1.92
29574507--29574540
14
2.4
15
90
9
54
47
41
0
11
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325