Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  57  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20737773--20737855
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2.9
14
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0
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27
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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35
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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100
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0
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20
1.99
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30
1.9
30
85
0
80
43
3
22
31
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21013400--21013641
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4.7
50
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4
297
26
24
29
19
1.99
21013400--21013649
100
2.4
103
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364
26
24
29
20
1.99
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12
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0
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1.99
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20
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0
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24
3
41
1.71
21037082--21037115
17
2.1
17
88
5
52
44
5
5
44
1.52
21052904--21052934
15
2.1
15
93
0
53
22
25
9
41
1.84
21057543--21057600
29
2.0
29
100
0
116
44
20
0
34
1.52
21060379--21060443
19
2.9
23
84
13
75
67
6
0
26
1.13
21061881--21062024
65
2.2
66
85
3
193
21
18
22
37
1.94
21062073--21062132
26
2.3
26
82
0
75
21
18
20
40
1.92
21064338--21064389
26
2.0
26
96
0
95
42
17
7
32
1.77
21070310--21070358
19
2.6
18
80
9
53
71
6
2
20
1.18
21072072--21072125
27
2.0
27
96
0
99
16
0
27
55
1.42
21085092--21085125
15
2.4
14
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9
50
41
2
0
55
1.15
21085095--21085124
15
2.0
15
93
0
51
33
3
0
63
1.11
21088484--21088581
36
2.9
36
80
7
116
65
5
5
24
1.34
21088540--21088581
22
1.9
22
85
0
57
69
2
4
23
1.20
21092313--21092369
26
2.2
26
96
0
105
40
24
8
26
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21092478--21092825
87
4.0
87
88
1
491
13
26
14
45
1.83
21103057--21103100
11
3.7
11
80
14
52
77
6
9
6
1.13
21103062--21103094
13
2.7
13
90
9
52
72
9
9
9
1.28
21106919--21106978
31
2.0
31
83
9
79
40
8
5
46
1.56
21107580--21107625
3
15.3
3
95
0
83
0
30
0
69
0.89
21109040--21109101
25
2.5
25
76
2
72
19
25
14
40
1.90
21112247--21112277
16
1.9
16
93
0
53
54
0
12
32
1.38
21123138--21123356
109
2.0
109
100
0
438
41
11
14
32
1.82
21129140--21129186
13
3.4
14
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11
53
34
0
0
65
0.93
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4
6.2
4
100
0
50
48
24
28
0
1.52
21141755--21141798
20
2.2
20
95
0
79
27
11
9
52
1.67
21155789--21156087
72
4.1
72
78
3
224
45
14
6
33
1.70
21159103--21159185
43
1.9
43
95
0
148
27
9
16
45
1.79
21163250--21163315
3
22.3
3
89
3
89
63
0
33
3
1.10
21164377--21164449
21
3.5
21
76
14
87
20
10
41
27
1.86
21164361--21164458
42
2.3
42
94
0
169
20
11
38
29
1.87
21164451--21164506
21
2.7
21
83
5
69
8
12
37
41
1.74
21164932--21165000
21
3.4
21
69
15
63
34
1
8
55
1.40
21165396--21165426
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
21169733--21169782
15
3.3
15
82
0
64
38
34
10
18
1.84
21169997--21170162
89
1.9
89
87
3
246
43
13
12
30
1.81
21170121--21170243
48
2.6
48
88
0
174
47
15
11
26
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21170270--21170435
6
26.7
6
74
9
82
55
14
9
20
1.67
21170959--21171029
31
2.3
31
80
7
83
25
12
16
45
1.83
21193519--21193583
32
2.1
30
88
5
94
26
3
13
56
1.52
21196826--21196881
28
2.0
28
96
0
103
35
16
21
26
1.94
21197088--21197113
13
2.0
13
100
0
52
76
0
7
15
0.99
21199509--21199586
34
2.3
34
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4
95
30
10
15
43
1.80
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2
12.5
2
100
0
50
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0
52
0
1.00
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3
16
36
1.65
21219703--21219747
22
2.1
22
87
4
65
62
0
11
26
1.29
21219998--21220034
9
4.1
9
85
0
56
59
2
0
37
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325