Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  307  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97393372--97394115
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2.8
269
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22
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1.97
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97425780--97425861
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10.8
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1
2
31
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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55
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22
24
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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24
17
1.96
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24
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1.98
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0
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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33
1.69
97602180--97602294
44
2.6
45
84
5
144
36
13
22
27
1.91
97603877--97603917
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
97608991--97609032
22
1.9
22
85
0
57
59
4
2
33
1.31
97616511--97616544
7
5.0
7
89
3
52
70
0
0
29
0.87
97616567--97616612
20
2.3
20
85
7
58
63
4
2
30
1.26
97616674--97616711
20
1.9
20
88
0
58
60
2
0
36
1.11
97617282--97617329
22
2.2
22
96
0
87
29
2
10
58
1.43
97621344--97621398
24
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24
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0
0
38
0.96
97623333--97623614
112
2.5
111
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5
460
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15
33
1.90
97627430--97627580
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30
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15
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1.96
97629121--97629515
105
3.7
108
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4
584
34
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15
34
1.88
97629423--97629588
91
1.8
89
91
5
271
27
17
15
40
1.89
97634950--97634979
6
5.0
6
100
0
60
16
16
16
50
1.79
97636230--97636274
22
2.1
21
84
8
56
57
8
8
24
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
19
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0
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0
2
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31
2.2
32
79
7
79
24
14
15
44
1.84
97640021--97640071
10
5.2
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23
50
41
7
0
50
1.31
97645303--97645374
19
3.8
19
90
3
119
37
15
11
36
1.83
97645303--97645374
37
1.9
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2
119
37
15
11
36
1.83
97645738--97646658
207
4.5
207
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1
1578
29
23
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28
1.97
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167
2.7
166
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2
708
24
22
23
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1.99
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1
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1
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0
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13
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0
14
0
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0.61
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0
15
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97648166--97648253
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2.1
41
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124
1
13
0
85
0.66
97648167--97648251
22
4.0
21
83
9
109
1
14
0
84
0.68
97648173--97648253
14
5.7
13
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18
83
0
14
0
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0.61
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18
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5
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1.81
97654007--97654094
35
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7
142
36
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2.0
42
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9
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0
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0
0
0.40
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27
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5
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0
0
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40
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8
111
23
20
26
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97677540--97677674
39
3.4
39
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20
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28
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1.9
27
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0
95
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17
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0
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19
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0
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0
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13
4.6
13
74
15
61
55
3
1
40
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325