Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  325  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102307504--102307554
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3
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0
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0
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1.22
102307504--102307554
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0
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35
0
5
58
1.22
102313382--102313429
4
12.0
4
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0
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22
0
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2.0
18
100
0
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27
22
22
27
1.99
102356563--102356655
43
2.2
43
92
3
152
27
6
13
51
1.66
102361299--102361391
43
2.2
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5
150
27
5
13
52
1.62
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6
100
0
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0
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2.1
31
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2.0
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0
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0
0
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100
0
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1.90
102410221--102410259
19
2.0
21
85
10
55
46
5
5
43
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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102423711--102423784
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2.1
36
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0
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18
37
1.91
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2.5
26
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102424513--102424568
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2.1
27
100
0
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2.0
160
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2
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19
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2.0
25
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15
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28
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0
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1.18
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0
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26
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1
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102486714--102486766
10
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1
30
1.13
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2.2
22
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27
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19
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0
0
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20
30
1.98
102502774--102503413
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7.3
90
81
6
675
25
22
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0.00
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38
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3
14
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1
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2.0
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16
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1.97
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2.0
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18
52
66
3
11
17
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102615416--102615484
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11
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1.67
102617101--102617131
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2.0
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0
50
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21
43
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51
14
19
27
38
1.91
102635444--102635562
58
2.1
58
100
0
238
35
3
18
42
1.67
102650808--102650843
13
2.6
14
86
13
56
61
16
8
13
1.56
102655959--102655986
3
9.3
3
100
0
56
0
35
0
64
0.94
102660554--102660618
32
2.1
32
97
2
123
47
12
9
30
1.72
102666137--102666179
11
3.4
12
84
15
52
0
9
18
72
1.11
102666174--102666208
13
2.7
13
86
0
52
0
20
5
74
1.02
102666752--102666813
32
2.0
32
96
3
117
46
12
8
32
1.71
102673505--102673588
31
2.6
31
79
5
87
40
9
19
30
1.83
102674244--102674502
133
1.9
132
89
5
405
42
15
8
33
1.78
102683905--102683949
22
2.1
22
83
4
56
26
11
11
51
1.71
102691098--102691307
51
4.3
51
88
9
328
29
24
15
30
1.95
102691098--102691307
95
2.1
97
91
6
334
29
24
15
30
1.95
102691208--102691314
44
2.5
40
98
0
133
30
22
15
30
1.95
102701864--102701895
12
2.7
12
100
0
64
9
25
0
65
1.22
102702103--102702401
50
5.9
50
80
5
264
23
27
21
27
1.99
102704233--102704320
25
3.6
24
74
10
70
19
25
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102704242--102704369
49
2.6
50
82
7
138
17
25
20
37
1.93
102704242--102704384
25
5.8
25
74
11
107
16
23
20
39
1.92
102712029--102712066
19
2.0
20
89
5
60
68
0
26
5
1.11
102712338--102712381
19
2.2
20
80
8
54
40
0
20
38
1.53
102718517--102718546
15
2.0
15
100
0
60
40
0
20
40
1.52
102722392--102722743
178
2.0
178
94
0
623
36
15
16
30
1.90
102724315--102724498
30
6.1
30
75
7
167
37
13
23
25
1.91
102724311--102724578
60
4.5
60
77
6
197
38
13
23
24
1.91
102724311--102724583
90
3.1
90
79
4
232
38
12
24
24
1.90
102724418--102724556
30
4.7
29
77
6
136
41
12
23
23
1.88
102724426--102724592
88
1.9
89
86
1
237
38
12
26
22
1.90
102732558--102732583
3
8.7
3
100
0
52
69
30
0
0
0.89
102745542--102745743
87
2.3
89
82
5
232
33
5
9
50
1.60
102745542--102745929
88
4.4
89
73
11
241
32
6
11
48
1.66
102745872--102745947
40
1.9
40
97
0
143
35
2
10
51
1.50
102758482--102758521
5
8.4
5
89
10
66
37
0
0
62
0.95
102766759--102766793
5
7.4
5
87
12
56
37
0
0
62
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325

The End!