Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  23  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8743776--8744075
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2
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18
2.0
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0
0
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9
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2.5
20
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7
1
82
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
36
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1
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0
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0
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1
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2.1
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0
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1.12
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18
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2
1
42
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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4
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0
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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1.9
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3
3
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2.0
22
100
0
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0
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0
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25
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18
29
1.95
8902116--8902239
38
3.4
38
71
20
138
68
2
3
25
1.17
8902142--8902201
32
1.9
31
83
6
77
66
3
3
26
1.23
8902115--8902260
70
2.1
70
98
0
283
65
3
2
28
1.22
8905955--8905991
18
2.2
18
85
9
51
21
2
0
75
0.92
8906108--8906177
8
9.3
7
87
6
59
22
0
4
72
1.01
8906121--8906178
15
3.9
15
88
4
91
20
0
1
77
0.86
8906130--8906177
14
3.4
14
85
2
69
20
0
0
79
0.74
8906108--8906203
8
11.9
8
80
14
56
26
0
5
68
1.10
8906547--8906591
21
2.1
21
87
0
63
44
35
6
13
1.70
8908057--8908207
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
8911530--8911572
22
2.0
22
90
0
68
51
9
0
39
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8911539--8911572
2
17.0
2
90
0
50
52
2
0
44
1.16
8916696--8916767
10
7.6
9
71
17
56
56
5
2
34
1.37
8916693--8916742
20
2.5
20
80
3
66
56
8
4
32
1.47
8919099--8919257
47
3.2
48
85
5
178
26
15
27
30
1.96
8919222--8919296
35
2.1
36
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9
91
21
17
30
30
1.96
8924727--8924756
16
1.9
16
93
6
53
80
0
0
20
0.72
8926401--8926426
8
3.2
8
100
0
52
0
11
0
88
0.52
8928337--8928390
27
2.1
26
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6
83
7
20
24
48
1.75
8935693--8935727
18
2.1
17
89
10
54
45
2
14
37
1.59
8936832--8936923
31
3.0
31
90
0
139
28
20
26
25
1.99
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42
2.7
43
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2
155
30
14
25
30
1.95
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93
1.8
93
93
0
299
27
29
21
21
1.99
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46
3.8
46
79
12
207
28
28
21
21
1.98
8940900--8940979
29
2.6
30
84
5
90
45
11
10
33
1.73
8940916--8940981
31
2.3
27
80
14
78
46
12
7
33
1.69
8942990--8943015
12
2.2
12
100
0
52
7
0
15
76
0.99
8945078--8945107
2
15.0
2
100
0
60
0
50
0
50
1.00
8961556--8961595
19
2.0
20
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4
55
50
0
2
47
1.14
8961765--8961844
41
2.0
41
94
0
142
30
21
7
41
1.80
8963985--8964039
27
2.0
27
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0
83
29
38
23
9
1.85
8965013--8965094
6
13.7
6
78
5
76
7
46
1
45
1.39
8971004--8971029
2
13.0
2
100
0
52
0
0
50
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8973504--8973536
15
2.2
15
89
10
50
81
0
18
0
0.68
8989673--8989801
15
8.9
14
73
17
70
25
6
1
65
1.26
8989673--8989780
29
3.8
28
69
18
78
25
7
1
64
1.30
8989713--8989827
21
5.2
24
72
20
83
28
8
0
62
1.25
8991100--8991165
32
2.1
32
83
13
84
43
13
9
33
1.76
8991263--8991317
21
2.6
21
80
11
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21
0
3
74
0.97
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12
2.1
12
100
0
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24
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2
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0
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0
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0
1.00
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60
1.54
9017796--9017857
30
2.1
31
90
6
101
24
3
11
61
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325