Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  191  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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Score
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.97
60358696--60358755
14
4.1
14
75
23
52
43
0
56
0
0.99
60358772--60358838
13
5.2
13
71
15
50
32
1
64
1
1.12
60358976--60359067
16
5.9
15
71
15
55
33
3
63
0
1.11
60359018--60359062
14
3.0
15
80
9
56
31
2
66
0
1.04
60359145--60359236
25
3.8
24
70
20
73
35
1
61
1
1.10
60359325--60359401
33
2.3
34
80
6
104
33
0
64
1
1.01
60359313--60359396
33
2.7
29
79
16
96
36
0
61
1
1.04
60359364--60359447
38
2.2
39
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12
95
32
0
66
1
0.99
60359473--60359607
14
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14
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22
70
37
0
61
0
1.07
60359460--60359564
29
3.6
30
76
14
96
37
0
61
0
1.02
60359506--60359691
53
3.6
53
68
22
137
36
0
61
2
1.08
60359708--60359752
16
2.9
16
78
18
51
28
0
66
4
1.11
60359756--60359818
23
2.8
24
72
18
62
47
1
47
3
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60359859--60359912
12
4.2
12
80
13
63
24
0
72
3
1.01
60359966--60360050
4
20.8
4
72
21
61
30
0
69
0
0.89
60359956--60360050
28
3.6
25
76
17
86
31
1
67
0
0.98
60359978--60360054
10
7.5
11
71
27
62
29
0
70
0
0.88
60359964--60360061
42
2.3
43
80
15
116
32
0
67
0
0.91
60359962--60360050
25
3.6
24
76
14
92
31
0
68
0
0.90
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8
13.9
8
69
22
62
35
0
64
0
1.00
60360091--60360175
24
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23
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29
65
42
0
56
1
1.07
60360133--60360189
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2.4
25
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11
66
45
0
52
1
1.11
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12
14.7
12
67
17
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34
0
62
1
1.09
60360480--60360618
24
6.0
24
74
18
93
35
0
64
0
0.99
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54
3.5
56
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15
159
36
0
61
1
1.09
60360425--60360620
7
29.4
7
66
18
80
35
0
62
1
1.09
60360420--60360624
66
3.1
68
76
14
168
36
0
61
1
1.09
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43
0
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0
0.99
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30
2.5
30
79
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44
0
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0
0.99
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15
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15
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46
0
53
0
1.00
60360827--60360894
19
3.5
19
66
20
50
44
0
55
0
0.99
60360967--60361113
29
4.7
31
69
16
92
36
2
59
2
1.20
60361010--60361112
20
5.2
20
64
15
52
33
2
63
0
1.10
60361154--60361226
15
4.7
15
72
21
53
35
2
58
2
1.26
60361194--60361357
16
10.8
16
67
23
54
32
0
65
1
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60361208--60361319
38
2.9
36
76
19
102
32
0
66
1
1.03
60361208--60361312
19
5.5
19
70
13
56
32
0
65
1
1.03
60361238--60361319
35
2.3
35
83
12
96
32
0
64
2
1.07
60361284--60361341
22
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24
0
75
0
0.80
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28
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29
0
70
0
0.87
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2.1
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66
31
0
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0
0.90
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2.4
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0
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1
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0
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20
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40
0
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0
0.98
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35
5.6
34
70
23
93
37
0
62
0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325