Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  67  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23824499--23825120
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43
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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5
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0
0
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1.98
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22
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2
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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18
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0
0
76
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23961671--23961708
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0
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0
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163
3.9
161
84
8
739
27
18
20
33
1.96
23969167--23969201
14
2.5
14
90
0
52
25
11
5
57
1.56
23969007--23969324
175
1.8
175
86
2
460
26
18
20
34
1.95
23969007--23969411
88
4.6
87
81
6
433
26
17
20
36
1.94
23970270--23970303
10
3.3
10
91
4
50
0
11
2
85
0.71
23970270--23970308
11
3.5
11
89
10
53
0
12
5
82
0.83
23973014--23973048
15
2.3
15
90
0
52
0
11
8
80
0.92
23975275--23975305
12
2.6
12
94
0
53
29
16
29
25
1.96
23975577--23975612
17
2.1
18
89
5
56
50
0
19
30
1.48
23975729--23975766
15
2.4
16
83
16
53
50
0
5
44
1.24
23975709--23975776
29
2.4
28
76
16
68
50
0
4
45
1.22
23977202--23977248
23
2.0
22
84
8
58
12
8
38
40
1.74
23978096--23978155
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
23978248--23978380
66
2.0
66
98
0
257
48
12
12
26
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23980661--23980752
44
2.1
44
86
8
125
38
25
19
17
1.93
23991175--23991218
8
5.5
8
84
10
63
38
0
0
61
0.96
23991175--23991221
16
2.9
17
87
9
71
40
0
0
59
0.97
23991179--23991226
24
2.0
24
84
15
64
41
0
2
56
1.11
24008019--24008108
45
2.0
45
88
0
135
34
17
12
35
1.87
24012484--24012547
19
3.4
18
74
8
56
32
1
1
64
1.13
24013808--24013849
21
2.0
21
100
0
84
38
19
14
28
1.90
24023953--24024103
75
2.0
75
94
0
266
32
25
23
18
1.97
24033622--24033661
14
2.8
15
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11
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5
20
0
75
0.99
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13
2.8
14
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11
53
7
20
0
71
1.10
24033686--24033729
18
2.5
17
79
20
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11
13
0
75
1.06
24036099--24036245
74
2.0
74
94
0
258
42
5
23
27
1.76
24037485--24037514
10
3.0
10
95
0
51
40
13
26
20
1.89
24045585--24045643
29
2.0
29
100
0
118
40
6
11
40
1.68
24045585--24045656
29
2.5
29
93
0
99
44
5
9
40
1.61
24045687--24045727
21
2.0
20
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4
55
53
0
0
46
1.00
24046033--24046100
12
5.0
14
77
17
63
36
0
4
58
1.18
24047009--24047063
17
3.2
17
78
14
60
23
12
7
56
1.61
24048180--24048273
48
2.0
48
81
8
111
23
18
30
27
1.97
24053450--24053556
20
5.3
20
69
22
64
58
5
2
32
1.35
24053489--24053558
22
3.2
22
69
23
58
58
4
4
32
1.37
24053986--24054026
3
14.0
3
84
5
57
63
0
4
31
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24053986--24054026
17
2.4
17
83
4
55
63
0
4
31
1.15
24054505--24054558
21
2.8
19
81
13
58
50
0
50
0
1.00
24054505--24054540
19
1.9
18
88
5
54
52
0
47
0
1.00
24062454--24062496
21
2.1
21
84
16
56
37
25
13
23
1.92
24066812--24066855
22
2.0
21
83
12
54
15
9
9
65
1.45
24078131--24078222
40
2.2
41
82
5
114
26
16
16
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42
2.2
40
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4
113
25
21
20
32
1.97
24082643--24082681
20
2.0
20
100
0
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10
0
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2.1
24
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3
68
75
1
23
0
0.91
24089155--24089223
18
3.8
18
75
12
70
27
8
18
44
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325