Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  290  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92885954--92886018
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3.1
21
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0
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20
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4.1
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0
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1.85
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4.9
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2
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100
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26
17
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62
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23
0
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70
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92938144--92938219
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0
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2.0
26
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21
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2.0
22
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18
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26
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18
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92968159--92968228
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1.9
36
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0
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16
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571
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19
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92971301--92971730
115
3.7
114
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506
22
10
18
48
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92971301--92971730
229
1.9
230
83
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569
22
10
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16
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2.3
22
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36
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1.91
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38
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13
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1.9
26
85
11
70
67
3
1
26
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
416
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8
1141
41
12
18
26
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93032114--93032816
391
1.8
390
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4
916
42
13
17
26
1.86
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1.9
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61
37
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1.50
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85
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30
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21
24
1.99
93043621--93043809
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1.99
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2.8
40
76
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113
23
20
20
35
1.96
93043816--93043915
41
2.4
41
80
8
123
23
20
19
38
1.94
93045124--93045180
16
3.6
15
76
19
62
38
21
5
35
1.76
93045898--93045938
13
3.1
13
89
6
64
0
24
0
75
0.80
93048604--93048666
18
3.6
18
80
4
56
30
23
25
20
1.99
93048614--93048669
18
3.3
17
82
5
60
25
21
30
23
1.99
93049593--93049654
28
2.2
28
80
5
72
50
8
20
20
1.74
93051563--93051613
18
2.9
18
94
2
86
49
37
0
13
1.43
93052033--93052073
17
2.4
16
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11
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19
9
0
70
1.14
93052778--93052820
11
3.9
11
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0
50
34
0
4
60
1.17
93065135--93066037
73
11.7
73
73
15
557
31
16
19
33
1.94
93065222--93066037
158
5.2
156
83
7
877
31
16
19
32
1.94
93065681--93066042
76
4.8
75
87
5
480
32
16
19
31
1.94
93065681--93066037
150
2.4
149
86
4
493
32
16
19
31
1.94
93067107--93067145
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93067345--93067379
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3.2
11
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11
54
0
54
0
45
0.99
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22
2.0
22
83
8
56
0
55
0
44
0.99
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11
3.9
11
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0
50
34
0
4
60
1.17
93073186--93073359
75
2.3
75
84
5
226
24
20
18
36
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40
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40
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18
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1.94
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24
17
19
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1.93
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24
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24
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0
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1
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1.33
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25
1.91
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15
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0
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2.5
20
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0
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0
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1.22
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18
2.4
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10
0
22
1.20
93110820--93110864
17
2.6
18
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16
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62
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24
1.43
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2.1
22
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4
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1.01
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9
5.8
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0
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12
2.1
12
100
0
50
16
24
36
24
1.94
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18
4.9
17
70
16
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29
1
4
64
1.21
93112952--93113066
54
2.2
54
90
3
180
29
1
4
64
1.23
93114386--93114451
31
2.1
31
88
0
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24
25
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1.99
93114650--93114686
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2.1
18
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0
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24
27
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1.83
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126
4.0
126
89
2
683
28
17
16
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93118360--93118453
30
3.0
30
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17
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34
3.7
34
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127
42
16
0
41
1.48
93118320--93118453
64
2.0
68
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8
186
42
17
0
40
1.49
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22
2.2
21
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7
58
40
12
0
46
1.42
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102
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1
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1.58
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1.9
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39
1.66
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331
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13
100
0
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7
7
44
1.60
93122534--93122622
18
4.9
18
72
5
63
32
29
30
7
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325