Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  252  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79989206--79989436
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4.8
46
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19
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80015386--80015501
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15
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
66
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.96
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1.99
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208
24
21
27
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1.99
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20
26
26
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29
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29
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29
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19
9
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80209771--80209849
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15
10
38
1.82
80209771--80209849
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22
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28
1.98
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6
9.8
6
75
12
50
5
11
0
83
0.81
80212152--80212199
18
2.6
18
81
15
62
6
10
0
83
0.81
80212176--80212213
11
3.5
11
86
13
60
2
13
0
84
0.73
80217815--80217861
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
80217832--80217929
19
5.2
19
87
7
146
36
15
10
37
1.81
80217832--80217929
36
2.6
37
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135
36
15
10
37
1.81
80217907--80217958
25
2.1
25
92
0
86
30
17
9
42
1.81
80224749--80224873
27
4.7
27
79
8
112
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24
8
28
1.85
80224749--80224918
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54
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157
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10
28
1.86
80224896--80225340
27
16.5
27
85
0
523
30
20
6
42
1.77
80224868--80224981
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54
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0
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8
41
1.81
80225291--80225377
45
1.9
46
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133
26
24
4
44
1.73
80225881--80226011
6
21.3
6
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16
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19
18
14
47
1.83
80225881--80225990
31
3.4
31
75
14
103
20
19
14
46
1.84
80225902--80226001
37
2.7
37
82
0
119
20
21
14
45
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80233554--80233701
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3.4
43
76
10
151
22
19
27
29
1.98
80233554--80233712
43
3.7
42
73
10
135
23
18
27
30
1.98
80234519--80234632
57
2.0
57
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0
201
26
16
22
34
1.95
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36
2.0
36
100
0
144
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16
25
30
1.97
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42
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144
23
18
27
30
1.98
80249437--80249592
40
3.9
40
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0
177
22
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1.94
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1.9
80
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219
22
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1.93
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2.7
63
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27
28
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26
1.98
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2
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2
1.02
80252321--80252355
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6
52
77
2
17
2
1.02
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1.9
25
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1.91
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10
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0
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22
22
1.95
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2.1
35
100
0
150
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1.88
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3
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35
0
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2.3
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236
24
22
27
25
2.00
80299263--80299446
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216
24
22
27
25
2.00
80299263--80299479
79
2.7
79
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7
201
25
22
27
24
2.00
80301369--80301503
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2.0
67
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0
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23
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1.89
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109
3.4
108
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3
470
23
27
12
36
1.91
80306094--80306400
51
5.7
51
68
12
168
24
28
12
35
1.91
80306792--80306890
27
3.7
27
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2
137
23
10
32
34
1.88
80321085--80321109
12
2.1
12
100
0
50
0
32
40
28
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80331523--80331788
47
5.7
47
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13
212
25
28
17
28
1.97
80331541--80331743
93
2.2
94
79
8
218
26
28
16
29
1.97
80331523--80331788
140
1.9
141
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8
346
25
28
17
28
1.97
80334040--80334208
47
3.6
47
80
13
206
24
30
18
26
1.98
80334038--80334259
93
2.4
93
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299
23
29
19
27
1.98
80334038--80334259
47
4.8
46
75
17
190
23
29
19
27
1.98
80336478--80336692
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55
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166
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15
26
27
1.96
80336478--80336692
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15
26
27
1.96
80339091--80339133
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2.2
19
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50
18
23
0
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1.9
31
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0
91
38
8
5
47
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325