Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  243  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76864584--76864616
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1.9
17
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0
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0
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0
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2.1
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0
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0
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1.12
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2.2
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2.0
40
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2.3
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66
20
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4
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22
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0
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0
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2.1
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0
0
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28
1.99
76940120--76940460
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3.8
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23
20
29
1.99
76940120--76940422
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2.3
135
89
1
448
26
23
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76940120--76940460
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135
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20
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1.99
76948726--76948794
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2.0
35
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2.9
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2.8
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0
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151
26
25
20
28
1.99
76977104--76977217
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1.97
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5
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1.9
55
84
2
138
26
8
14
50
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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4.3
131
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0
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11
39
1.84
77017798--77018356
263
2.1
262
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15
11
39
1.84
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2.0
25
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0
100
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0
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1.74
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14
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0
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0
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1.96
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1.97
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1.94
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1.88
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18
20
1.96
77062639--77062810
93
1.8
93
86
2
247
30
29
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77065191--77065279
30
3.0
30
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11
94
56
15
17
10
1.67
77065191--77065273
15
5.6
14
73
10
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55
16
18
9
1.68
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5.2
15
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70
55
15
17
11
1.69
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1.9
93
93
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29
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21
1.98
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28
21
21
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5.0
22
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18
21
22
1.94
77073294--77073406
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22
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24
3.6
24
76
10
72
39
19
18
22
1.92
77079432--77079471
16
2.4
17
87
4
55
60
22
10
7
1.54
77083920--77083980
32
1.9
32
89
0
95
29
19
32
18
1.95
77084409--77084484
40
1.9
40
88
0
116
17
13
32
36
1.88
77084408--77084492
40
2.2
38
81
8
107
17
12
32
36
1.88
77093354--77093387
17
2.0
17
100
0
68
41
29
11
17
1.85
77097321--77097365
23
2.0
23
82
8
56
44
0
4
51
1.21
77102842--77102866
4
6.2
4
100
0
50
76
0
0
24
0.80
77103020--77103060
22
1.9
22
90
5
66
65
9
9
14
1.46
77105392--77105466
29
2.6
28
77
12
71
58
0
4
37
1.17
77105392--77105458
29
2.3
29
82
10
75
56
0
2
40
1.14
77105801--77105834
17
1.9
18
94
5
61
29
5
2
61
1.34
77105856--77105904
21
2.3
21
78
0
53
36
0
2
61
1.08
77105777--77105939
9
17.0
9
69
18
89
32
1
3
62
1.21
77106687--77106715
14
2.0
15
93
6
51
62
3
0
34
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77110549--77110578
16
1.9
16
93
6
53
53
10
0
36
1.35
77111952--77111982
13
2.4
13
94
0
53
32
3
0
64
1.09
77113502--77113553
20
2.6
20
93
0
86
11
25
36
26
1.90
77115386--77115469
28
3.2
28
65
25
74
25
15
29
29
1.96
77115338--77115526
50
3.8
49
83
2
216
26
17
26
29
1.98
77122693--77122779
46
1.9
45
90
2
138
36
6
20
35
1.80
77122701--77122797
46
2.1
46
84
1
124
35
9
24
30
1.87
77122781--77122845
29
2.2
29
83
5
78
29
16
32
21
1.96
77126248--77126298
22
2.3
22
89
0
75
17
37
1
43
1.61
77133816--77133930
27
4.3
26
83
5
131
36
21
24
17
1.94
77133816--77133930
54
2.1
54
85
3
151
36
21
24
17
1.94
77135546--77135653
26
4.2
26
92
4
173
37
24
4
34
1.76
77136574--77136693
56
2.1
56
98
0
231
45
9
23
22
1.81
77137822--77138045
40
5.6
40
85
7
278
24
23
28
24
2.00
77137821--77138078
119
2.2
119
81
6
292
25
22
27
24
2.00
77142347--77142461
27
4.3
26
86
5
140
36
22
23
17
1.95
77142347--77142461
54
2.1
54
87
3
160
36
22
23
17
1.95
77144079--77144214
26
5.2
26
98
0
236
36
25
5
33
1.78
77148961--77148996
10
3.6
10
92
7
56
72
11
0
16
1.12
77154722--77154750
12
2.3
13
94
5
51
58
13
6
20
1.58
77155563--77155726
42
3.9
42
84
6
197
31
14
22
31
1.94
77155563--77155726
85
1.9
84
82
6
206
31
14
22
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77159692--77159750
21
2.8
21
71
0
55
18
18
16
45
1.85
77159693--77159775
42
2.0
42
85
0
112
15
20
18
45
1.85
77170520--77170580
20
3.0
20
75
15
52
50
13
3
32
1.57
77172744--77172895
29
5.4
28
78
4
128
27
14
30
26
1.95
77177184--77177219
18
2.0
18
94
0
63
25
19
38
16
1.92
77177308--77177440
29
4.7
29
75
8
112
28
15
31
24
1.95
77180228--77180285
29
2.0
30
83
6
75
32
20
0
46
1.51
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207
25
16
28
29
1.97
77185901--77186134
49
4.7
49
81
6
265
31
26
16
25
1.96
77186051--77186128
26
3.1
26
62
23
67
32
28
14
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325