Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  29  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10820708--10820735
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0
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0
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0
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0
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2.7
20
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70
10
0
44
46
1.37
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3.1
86
88
0
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26
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134
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1
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2.0
440
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4.1
396
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1720
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24
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0
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1.98
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3.5
50
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2
221
27
20
15
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10897355--10897494
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3.2
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25
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28
1.98
10897377--10897496
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2.8
44
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29
24
17
29
1.97
10897798--10897838
21
2.0
21
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10898397--10898434
19
2.1
18
85
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52
0
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10907182--10907341
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0
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1.13
10913209--10913240
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35
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0
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55
10
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3
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19
64
0
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10919329--10919387
24
2.5
24
77
0
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27
55
3
13
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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4
1.15
10924160--10924222
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2.5
24
82
5
72
63
0
33
3
1.10
10924160--10924245
16
5.3
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50
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1
31
2
1.13
10924303--10924346
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1.9
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81
9
54
18
0
13
68
1.22
10924343--10924401
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2.4
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38
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10
44
1.65
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145
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1529
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8
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56
1.53
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29
2.2
28
76
7
67
26
7
3
63
1.36
10930752--10931950
295
4.1
296
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1696
29
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6
56
1.53
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2.1
133
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360
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6
55
1.54
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0
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9
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0
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0
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1.15
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13
71
46
0
2
50
1.15
10951171--10951227
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10
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38
0
5
56
1.22
10953114--10953191
31
2.4
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93
4
133
17
15
2
64
1.41
10953114--10953194
33
2.5
31
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4
135
17
14
2
65
1.38
10959640--10959701
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2.0
32
90
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99
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0
11
32
1.35
10962123--10962213
26
3.6
25
76
11
78
45
0
1
53
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10962145--10962207
9
7.2
9
74
12
51
41
0
1
57
1.08
10962125--10962212
35
2.6
34
78
3
95
45
0
1
53
1.07
10962134--10962213
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4.6
17
74
11
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45
0
1
53
1.08
10969405--10969438
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50
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29
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0
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50
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2.8
12
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4
50
6
21
6
66
1.35
11044574--11044644
32
2.1
34
82
10
85
43
4
1
50
1.30
11058367--11058595
112
2.0
111
88
3
334
36
14
13
34
1.86
11062065--11062106
8
5.0
8
83
11
57
76
0
2
21
0.90
11062062--11062106
18
2.7
16
87
12
72
75
0
2
22
0.91
11066807--11066974
84
2.0
84
100
0
336
50
16
10
22
1.76
11070247--11070291
9
4.9
9
82
12
56
62
2
0
35
1.08
11070247--11070291
17
2.5
17
89
10
63
62
2
0
35
1.08
11074661--11074702
18
2.3
19
80
12
52
38
2
4
54
1.34
11077806--11078175
183
2.0
183
88
0
551
25
24
18
31
1.98
11086438--11086507
27
2.6
27
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9
70
54
2
0
42
1.15
11086477--11086502
13
2.0
13
100
0
52
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0
0
46
1.00
11086965--11087148
93
2.0
93
86
0
260
47
10
10
31
1.71
11088492--11088628
75
1.9
74
88
7
210
48
2
7
41
1.46
11089836--11089874
21
2.0
21
85
10
55
53
0
10
35
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11094852--11094888
19
1.9
19
100
0
74
10
10
29
48
1.72
11107865--11107889
7
3.6
7
100
0
50
60
0
28
12
1.32
11118066--11118122
27
2.1
27
83
6
71
50
10
0
38
1.37
11118519--11118590
35
2.1
35
89
5
110
40
12
20
26
1.88
11123676--11123747
35
2.1
35
92
5
119
37
12
23
26
1.90
11126692--11126789
23
4.3
23
89
2
153
30
26
22
20
1.98
11126700--11126787
45
2.0
45
95
0
158
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27
22
19
1.98
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2
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22
21
1.99
11133489--11133576
45
2.0
45
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0
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30
26
22
20
1.98
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20
2.8
20
83
0
76
55
0
3
41
1.17
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22
2.0
23
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4
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53
2
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1.33
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22
2.0
22
100
0
90
13
26
4
55
1.57
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16
2.1
16
100
0
66
36
0
6
57
1.23
11152300--11152360
31
2.0
30
84
9
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22
4
4
67
1.30
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21
2.5
21
96
0
95
44
0
7
48
1.31
11168899--11168961
30
2.1
30
82
14
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1
3
49
1.27
11178559--11178633
31
2.4
30
86
0
87
50
6
8
34
1.58
11180013--11180060
21
2.2
23
77
11
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22
2
31
43
1.65
11180015--11180061
22
2.2
22
84
3
60
25
2
29
42
1.67
11180029--11180071
22
2.0
22
90
0
68
23
0
34
41
1.55
11182641--11182760
53
2.3
53
92
0
195
29
25
17
27
1.98
11184629--11184663
5
7.0
5
93
0
61
37
0
0
62
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11184687--11184755
4
17.0
4
75
19
63
72
2
21
2
1.11
11184685--11184754
33
2.1
34
89
2
106
74
2
20
2
1.08
11185043--11185080
18
2.1
19
85
5
51
44
0
21
34
1.52
11186833--11186881
20
2.5
20
76
6
55
28
0
10
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1.29
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19
2.1
20
90
4
66
46
0
2
51
1.14
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15
2.1
16
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57
50
0
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37
1.41
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12
2.9
12
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32
0
0
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0.91
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0
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0
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68
0
0
32
0.90
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17
2.8
18
81
15
57
14
6
6
72
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325